More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0831 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 263 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 263 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  91.3 
 
 		 263 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  79.47 
 
 		 272 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  79.09 
 
 		 263 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  76.63 
 
 		 267 aa  397  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  75.47 
 
 		 265 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  64.94 
 
 		 279 aa  344  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  64.58 
 
 		 278 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  65.31 
 
 		 278 aa  333  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  62.5 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  61.85 
 
 		 279 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  65.73 
 
 		 278 aa  327  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  64.21 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  61.48 
 
 		 279 aa  326  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  62.36 
 
 		 281 aa  325  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  61.11 
 
 		 279 aa  323  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  62.75 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  62.21 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  61.45 
 
 		 279 aa  322  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  63.1 
 
 		 278 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  64.21 
 
 		 275 aa  321  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  66.53 
 
 		 278 aa  321  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  61.83 
 
 		 279 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  61.03 
 
 		 279 aa  316  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  57.68 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  61.99 
 
 		 277 aa  316  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  58.43 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  58.05 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  58.05 
 
 		 269 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  61.99 
 
 		 279 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  57.36 
 
 		 270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  58.37 
 
 		 269 aa  310  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  57.59 
 
 		 268 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  57.3 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  57.3 
 
 		 269 aa  304  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  62.6 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  56.98 
 
 		 270 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  55.43 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  64.68 
 
 		 278 aa  298  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  64.26 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  64.26 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  63.46 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  58.82 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  51.71 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  51.16 
 
 		 267 aa  252  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 271 aa  251  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  53.97 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  58.72 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  51.25 
 
 		 266 aa  238  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  48.09 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  49.4 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  53.69 
 
 		 276 aa  235  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  56.88 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  49.17 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  51.53 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  53.36 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  52.05 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  44.96 
 
 		 272 aa  226  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  44.96 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  45.53 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  42.25 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  48.52 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  48.52 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 		 267 aa  221  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  46.09 
 
 		 268 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  47.11 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  44.63 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  49.16 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  44.63 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 265 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  47.72 
 
 		 285 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  45.68 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  46.69 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  49.17 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  44.86 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  44.9 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  46.28 
 
 		 265 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  48.76 
 
 		 285 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  51.32 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  45.45 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  42.62 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  43.7 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  45.97 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  43.63 
 
 		 302 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  43.46 
 
 		 272 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 272 aa  211  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  43.32 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  43.57 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  45.49 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  45.42 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>