217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0802 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  100 
 
 
355 aa  722    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  99.44 
 
 
355 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  90.14 
 
 
355 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  63.53 
 
 
349 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  63.53 
 
 
349 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  52.1 
 
 
344 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  55.75 
 
 
354 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  51.13 
 
 
346 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  51.56 
 
 
346 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  51.84 
 
 
346 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  50.28 
 
 
360 aa  364  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  48.88 
 
 
355 aa  358  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  55.46 
 
 
349 aa  358  7e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  52.12 
 
 
352 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  50.14 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  51.43 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  50.7 
 
 
353 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  49.15 
 
 
352 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  49.86 
 
 
342 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  47.9 
 
 
350 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  51.27 
 
 
342 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  32.56 
 
 
311 aa  195  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  31.35 
 
 
312 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  28.65 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  29.6 
 
 
333 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  26.01 
 
 
311 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  31.98 
 
 
307 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  29.48 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  28.49 
 
 
313 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  30.15 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  29.65 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  28.83 
 
 
307 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  29.11 
 
 
307 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  34.5 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  28.86 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  28.53 
 
 
307 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  28.82 
 
 
307 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  27.48 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  29.21 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  29.21 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  28.53 
 
 
307 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  29.21 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  29.11 
 
 
307 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  29.95 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  27.67 
 
 
307 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  28.04 
 
 
307 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.34 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  24.27 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  24.52 
 
 
320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  30.28 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  25.63 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  28.28 
 
 
307 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  30.89 
 
 
350 aa  126  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  28.18 
 
 
402 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  26.52 
 
 
444 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  25.71 
 
 
438 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  28.71 
 
 
311 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  27.4 
 
 
381 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  28.84 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  27.55 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  28 
 
 
415 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  30.7 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  27.88 
 
 
297 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  36.04 
 
 
344 aa  119  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  25.31 
 
 
317 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  28.53 
 
 
433 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  26.46 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  29.18 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  30.08 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  28.27 
 
 
392 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  26.9 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  33.09 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  27.53 
 
 
390 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  27.34 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  26.32 
 
 
409 aa  109  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  27.58 
 
 
394 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  27.82 
 
 
327 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  26.97 
 
 
323 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  26.97 
 
 
323 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  26.59 
 
 
323 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  26.97 
 
 
323 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  26.55 
 
 
449 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  26.97 
 
 
323 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  26.97 
 
 
323 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  26.58 
 
 
420 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  22.95 
 
 
439 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  26.48 
 
 
429 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  27.55 
 
 
323 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  26.06 
 
 
323 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  26.45 
 
 
390 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  26.59 
 
 
323 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  27.51 
 
 
363 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  29.36 
 
 
362 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  30.83 
 
 
345 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  24.62 
 
 
428 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  25.63 
 
 
402 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  25.84 
 
 
323 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  27.73 
 
 
602 aa  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  25.13 
 
 
456 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  27.65 
 
 
324 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>