234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0739 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  90.64 
 
 		 235 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  55.7 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  54.47 
 
 		 242 aa  252  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  54.78 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  55.75 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  38.76 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  36.68 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  35.32 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  38.29 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  36.64 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  31.86 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  38.16 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  38.33 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  37.44 
 
 		 242 aa  121  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  33.77 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  36.93 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  31.72 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  36.2 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  30.97 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  34.39 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  31.51 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  35.48 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  31.51 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  31.51 
 
 		 285 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  31.65 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  35.71 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  30.42 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  33.48 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  29.96 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  34.16 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  28.75 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  32.74 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  31.44 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  32.2 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  28.89 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  34.22 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  34.22 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  33.17 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  29.17 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  30.7 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  33.04 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  29.18 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  31.84 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  29.39 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  28.27 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  33.33 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  29.72 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  33.48 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  28.39 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  28.25 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  29.41 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  31.6 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  31.6 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  32.44 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  27.07 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  25.75 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  31.03 
 
 		 292 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  31.17 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  26.11 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  28.26 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  31.47 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  32.22 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  34.89 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  32.22 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  33.14 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  27.11 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  30.51 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  30.54 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  31.05 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  26.61 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  26.61 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  26.61 
 
 		 251 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  26.48 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  27.78 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  26.2 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  23.61 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  30.56 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  28.96 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  27.47 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  28.21 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  28.21 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  28.21 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.21 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.78 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  28.02 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.78 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  28.1 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  28.02 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  28.02 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  29.49 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  25.94 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.35 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  26.09 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  27.35 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  31.67 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.78 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  27.72 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>