48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0689 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0689  RdxS, cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  100 
 
 		 52 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2344  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  100 
 
 		 52 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.005747  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0541  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  94.23 
 
 		 52 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0668  nitrogen fixation protein fixS  61.54 
 
 		 52 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2537  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  62.75 
 
 		 52 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.544754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3850  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  60.78 
 
 		 51 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2394  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  60 
 
 		 49 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1841  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  68.63 
 
 		 52 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.752345  normal  0.421653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5023  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  55.77 
 
 		 52 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4955  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  62.22 
 
 		 52 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000981596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7464  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  57.78 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3323  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  64.29 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0243934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6714  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  55.56 
 
 		 45 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1525  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  64.29 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5919  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  58.82 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.662161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0462  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  62.22 
 
 		 52 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5928  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  59.52 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.657419 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1156  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.11 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.0826721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.06 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0008  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2444  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56 
 
 		 54 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116458  normal  0.535844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2571  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.75 
 
 		 49 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.831521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0737  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56.76 
 
 		 55 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.95036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1795  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  73.81 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2256  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.62 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0217106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1052  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.43 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1995  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.28 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.407314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1791  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.4 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1178  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  49.02 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1606  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.81 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0765964  normal  0.010544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4262  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.81 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02297  hypothetical protein  42 
 
 		 54 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1226  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.68 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.012112  normal  0.558991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2220  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.54 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.482957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2611  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.68 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38073  normal  0.51835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1340  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1238  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3580  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.68 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1963  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.62 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1953  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  31.37 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.68 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2113  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.62 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.110001  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3827  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.68 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2012  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.62 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000291515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1845  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.1 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224574  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4493  hypothetical protein  35.71 
 
 		 71 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2207  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.71 
 
 		 71 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>