More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0647 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
267 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  99.25 
 
 
267 aa  520  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  89.89 
 
 
267 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  57.3 
 
 
285 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 
268 aa  274  9e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  55.68 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  58.71 
 
 
269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  57.31 
 
 
266 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  56.92 
 
 
267 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  58.09 
 
 
277 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  54.23 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  55.97 
 
 
274 aa  250  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  52.12 
 
 
267 aa  250  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 
266 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  52.71 
 
 
266 aa  248  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
267 aa  248  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  51.55 
 
 
266 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  53.64 
 
 
271 aa  246  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
266 aa  245  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
266 aa  245  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
266 aa  245  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
266 aa  245  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
266 aa  245  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
266 aa  245  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  50.78 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  56.32 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 
269 aa  243  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 
266 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  53.85 
 
 
271 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
267 aa  240  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  53.48 
 
 
518 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  54.79 
 
 
268 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  56.32 
 
 
268 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  53.79 
 
 
531 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  56.54 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  53.82 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  54.2 
 
 
268 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 
267 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
266 aa  238  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  55.26 
 
 
270 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  51.31 
 
 
284 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 
285 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.82 
 
 
268 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  51.49 
 
 
297 aa  235  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
266 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
266 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
267 aa  234  9e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 
268 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  53.64 
 
 
265 aa  231  8.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 
268 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  55.13 
 
 
269 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
262 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 
269 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 
269 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  55.51 
 
 
269 aa  228  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 
269 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 
304 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 
270 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 
267 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 
323 aa  225  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  54.75 
 
 
269 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
283 aa  225  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 
291 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  54.75 
 
 
269 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
499 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  51.55 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 
490 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  56.28 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  46.31 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  53.21 
 
 
335 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
267 aa  219  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 
264 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 
269 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 
282 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 
264 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
264 aa  214  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  51.33 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 
295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  51.63 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
290 aa  211  7e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  50.54 
 
 
289 aa  211  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  46.54 
 
 
277 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  50.61 
 
 
284 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 
260 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  45.69 
 
 
277 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  55.33 
 
 
265 aa  208  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.257449  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 
288 aa  208  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 
265 aa  208  7e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>