More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0594 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  71.03 
 
 
504 aa  768  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  92.61 
 
 
501 aa  970  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  99.2 
 
 
501 aa  1027  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  74.5 
 
 
502 aa  798  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  76.19 
 
 
504 aa  788  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  71.46 
 
 
512 aa  760  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  76.1 
 
 
502 aa  787  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  68.92 
 
 
502 aa  711  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  75.65 
 
 
498 aa  790  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  100 
 
 
501 aa  1032  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  72.64 
 
 
496 aa  758  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  50 
 
 
509 aa  485  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  9.29958e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  50.4 
 
 
518 aa  482  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  50.59 
 
 
516 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  50.59 
 
 
516 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  50.78 
 
 
516 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  50.39 
 
 
516 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  50.1 
 
 
522 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  50.1 
 
 
522 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  50.1 
 
 
522 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  50.99 
 
 
511 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  50 
 
 
511 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  50.1 
 
 
517 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  50.79 
 
 
511 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  50.1 
 
 
522 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  50.1 
 
 
517 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  50.1 
 
 
522 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  49.5 
 
 
517 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  49.12 
 
 
515 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  49.01 
 
 
512 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  48.01 
 
 
505 aa  459  1e-128  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  47.81 
 
 
505 aa  461  1e-128  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.95462e-10 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  47.43 
 
 
513 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  48.61 
 
 
503 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  47.81 
 
 
505 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  47.21 
 
 
505 aa  455  1e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  9.26567e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  46.92 
 
 
502 aa  453  1e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  46.02 
 
 
510 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  47.82 
 
 
503 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  45.42 
 
 
501 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  44.82 
 
 
501 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  43.56 
 
 
520 aa  399  1e-110  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  46.84 
 
 
594 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  43.56 
 
 
503 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  31.95 
 
 
489 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  31.37 
 
 
482 aa  204  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  31.3 
 
 
476 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  32.68 
 
 
497 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  30.16 
 
 
474 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  31.86 
 
 
486 aa  165  2e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  32.75 
 
 
496 aa  162  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  28.39 
 
 
586 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  29.08 
 
 
487 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  33.05 
 
 
535 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  31.13 
 
 
480 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  32.11 
 
 
511 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  28.82 
 
 
499 aa  150  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  27.39 
 
 
497 aa  148  2e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  27.71 
 
 
481 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  27.11 
 
 
480 aa  147  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  26.78 
 
 
497 aa  147  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  27.39 
 
 
497 aa  146  7e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  27.39 
 
 
497 aa  146  7e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  27.39 
 
 
497 aa  146  7e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  28.38 
 
 
514 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  29.19 
 
 
489 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  27 
 
 
497 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  28.92 
 
 
493 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  28.37 
 
 
549 aa  143  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  28.48 
 
 
523 aa  143  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  28.19 
 
 
536 aa  141  2e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  29.5 
 
 
565 aa  140  4e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  28.85 
 
 
497 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.26 
 
 
501 aa  140  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.51 
 
 
526 aa  139  9e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  27.43 
 
 
502 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  24.67 
 
 
473 aa  138  3e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  25.35 
 
 
535 aa  138  3e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  29.87 
 
 
449 aa  138  3e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  31.14 
 
 
478 aa  138  3e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.88 
 
 
479 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  26.08 
 
 
458 aa  135  2e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  27.72 
 
 
482 aa  135  2e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  28.42 
 
 
483 aa  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  28.09 
 
 
508 aa  132  1e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  27.97 
 
 
459 aa  131  2e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  29.26 
 
 
519 aa  132  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  29.14 
 
 
478 aa  131  4e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  27.27 
 
 
572 aa  129  1e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  30.23 
 
 
489 aa  129  1e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  26.71 
 
 
523 aa  129  1e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  28.8 
 
 
554 aa  129  1e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.18 
 
 
457 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  26.72 
 
 
489 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  26.5 
 
 
498 aa  126  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  26.91 
 
 
519 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  27.47 
 
 
518 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  28.6 
 
 
508 aa  122  1e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  24.59 
 
 
512 aa  121  2e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  30.47 
 
 
482 aa  122  2e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>