76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0534 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 100 aa  204  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  100 
 
 		 100 aa  204  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  78.22 
 
 		 101 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  58.06 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  58.06 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  52.75 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  51.04 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  50.53 
 
 		 97 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  55.43 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  56.7 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.54 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  51.55 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.54 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.48 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  63.33 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  55.67 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  53.61 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  61.8 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  54.17 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.94 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57.14 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.44 
 
 		 102 aa  93.2  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  59.55 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  47.96 
 
 		 87 aa  90.1  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.52 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  53.12 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  53.12 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50.52 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  45.36 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  55.68 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  54.84 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.39 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.36 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  55.91 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  50 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  46.39 
 
 		 87 aa  83.6  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  46.39 
 
 		 87 aa  83.6  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  48.45 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  47.13 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  42.27 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  39.18 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  37.11 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  34.69 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  28.87 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.77 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 		 421 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  48.57 
 
 		 51 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1080  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  32.88 
 
 		 1190 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1261  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 		 1222 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0879  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 		 381 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1848  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 604 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3419  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  35.53 
 
 		 1195 aa  43.5  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.26 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0368  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 1193 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.73 
 
 		 266 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3918  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  34.67 
 
 		 1212 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0639  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  27.06 
 
 		 200 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.18 
 
 		 652 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.03 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3046  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  34.25 
 
 		 1190 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.76 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.08 
 
 		 394 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3966  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  33.33 
 
 		 1212 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.26 
 
 		 432 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0030  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.18 
 
 		 665 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.27 
 
 		 437 aa  40.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.94 
 
 		 369 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0799  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 1192 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000076441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.18 
 
 		 665 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 		 491 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0114933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  31.34 
 
 		 315 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.89 
 
 		 966 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0544  cysteine-rich domain-contain protein  32 
 
 		 370 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>