More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0429 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  55.52 
 
 		 611 aa  663    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 618 aa  1211    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  62.95 
 
 		 626 aa  715    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  99.51 
 
 		 618 aa  1206    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  67.43 
 
 		 615 aa  774    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  66.78 
 
 		 615 aa  730    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  69.93 
 
 		 619 aa  822    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  92.07 
 
 		 618 aa  1060    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  56.01 
 
 		 616 aa  679    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  64.48 
 
 		 623 aa  708    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  56.46 
 
 		 638 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  43.69 
 
 		 623 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  42.17 
 
 		 625 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  42.19 
 
 		 625 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  40.72 
 
 		 609 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  42.38 
 
 		 621 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  42.38 
 
 		 621 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  42.38 
 
 		 621 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  38.42 
 
 		 604 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.41 
 
 		 603 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  37.39 
 
 		 614 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  41.53 
 
 		 603 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  37.16 
 
 		 611 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  44.21 
 
 		 625 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  34.51 
 
 		 592 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  37.35 
 
 		 613 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  37.52 
 
 		 618 aa  359  7e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.99 
 
 		 600 aa  349  8e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  33.33 
 
 		 613 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  36.16 
 
 		 608 aa  317  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  36.48 
 
 		 608 aa  312  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  39.96 
 
 		 626 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  39.41 
 
 		 606 aa  306  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  35.45 
 
 		 605 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  34.35 
 
 		 619 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  36.83 
 
 		 621 aa  296  7e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 616 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 616 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  30.04 
 
 		 566 aa  280  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  40.84 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  29.98 
 
 		 597 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  32.45 
 
 		 626 aa  273  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  31.34 
 
 		 605 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  33.23 
 
 		 611 aa  269  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.64 
 
 		 587 aa  265  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  27.17 
 
 		 608 aa  264  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.83 
 
 		 633 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  33.22 
 
 		 633 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  35.25 
 
 		 662 aa  253  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  27.96 
 
 		 606 aa  251  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  32.35 
 
 		 595 aa  250  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  34.54 
 
 		 578 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  27.41 
 
 		 618 aa  246  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.25 
 
 		 594 aa  241  4e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  28.65 
 
 		 604 aa  240  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  34.75 
 
 		 586 aa  237  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  34.21 
 
 		 665 aa  238  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  37.2 
 
 		 500 aa  237  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  33.5 
 
 		 627 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  25.65 
 
 		 603 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.8 
 
 		 586 aa  232  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  29.89 
 
 		 603 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  42.96 
 
 		 631 aa  230  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 596 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  37.11 
 
 		 673 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.15 
 
 		 580 aa  229  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  32.34 
 
 		 705 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.58 
 
 		 598 aa  228  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  33.51 
 
 		 653 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 		 596 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  28.42 
 
 		 624 aa  226  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  33 
 
 		 647 aa  225  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  32.95 
 
 		 728 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  32.82 
 
 		 728 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  27.33 
 
 		 593 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  28.59 
 
 		 619 aa  222  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.65 
 
 		 609 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  32.65 
 
 		 610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 604 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 623 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  27.09 
 
 		 611 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.71 
 
 		 616 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.68 
 
 		 597 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 590 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  27.55 
 
 		 619 aa  217  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  36.87 
 
 		 618 aa  216  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  32.62 
 
 		 611 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  40.44 
 
 		 634 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.92 
 
 		 590 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.49 
 
 		 641 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.59 
 
 		 639 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.17 
 
 		 592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.9 
 
 		 618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  31.28 
 
 		 601 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  41.7 
 
 		 626 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  34.03 
 
 		 617 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.14 
 
 		 612 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  31.84 
 
 		 725 aa  213  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 596 aa  213  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  40.63 
 
 		 618 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>