More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0366 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  73.49 
 
 
430 aa  656  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
430 aa  864  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  99.53 
 
 
430 aa  862  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  72.56 
 
 
430 aa  655  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  96.98 
 
 
430 aa  842  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  74.19 
 
 
430 aa  662  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  72.09 
 
 
429 aa  636  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  84.45 
 
 
431 aa  740  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  82.83 
 
 
431 aa  735  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  82.38 
 
 
437 aa  736  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  80 
 
 
430 aa  709  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  70.7 
 
 
430 aa  642  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  70.37 
 
 
432 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  72.09 
 
 
429 aa  628  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  70.14 
 
 
432 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  69.46 
 
 
457 aa  630  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  71.3 
 
 
431 aa  628  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  70.47 
 
 
429 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  71.4 
 
 
533 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  71.63 
 
 
429 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  69.23 
 
 
430 aa  626  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  71.4 
 
 
448 aa  625  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  68.3 
 
 
430 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  68.07 
 
 
430 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  70.14 
 
 
432 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  68.93 
 
 
429 aa  619  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  69.21 
 
 
432 aa  620  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  68.3 
 
 
430 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  70.47 
 
 
429 aa  619  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  69.53 
 
 
429 aa  619  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  69.68 
 
 
432 aa  620  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  67.83 
 
 
430 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  68.84 
 
 
448 aa  616  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  68.84 
 
 
430 aa  616  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  67.6 
 
 
430 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  68.6 
 
 
430 aa  613  1e-174  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  69.14 
 
 
431 aa  608  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  69.23 
 
 
428 aa  604  1e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  65.35 
 
 
429 aa  582  1e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  65.12 
 
 
429 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  63.95 
 
 
429 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  55.16 
 
 
425 aa  509  1e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 
430 aa  480  1e-134  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  57.11 
 
 
429 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  57.11 
 
 
432 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  57.11 
 
 
453 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  56.88 
 
 
429 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  57.11 
 
 
432 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 
431 aa  477  1e-133  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  55.94 
 
 
432 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  57.11 
 
 
432 aa  471  1e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  55.09 
 
 
436 aa  466  1e-130  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  54.57 
 
 
432 aa  461  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  53.35 
 
 
435 aa  459  1e-128  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  54.1 
 
 
431 aa  460  1e-128  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  52.05 
 
 
446 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  52.76 
 
 
442 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.40547e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  52.86 
 
 
446 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 
432 aa  452  1e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
432 aa  453  1e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.206e-11 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  53.67 
 
 
440 aa  452  1e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  2.27018e-07 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 
430 aa  454  1e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  53.74 
 
 
432 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.34883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 
431 aa  445  1e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  51.04 
 
 
433 aa  445  1e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2096  adenylosuccinate synthetase  53.44 
 
 
447 aa  448  1e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1434  adenylosuccinate synthetase  51.45 
 
 
459 aa  446  1e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104272  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2198  adenylosuccinate synthetase  53.23 
 
 
443 aa  447  1e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  53.52 
 
 
430 aa  446  1e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 
431 aa  446  1e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2076  adenylosuccinate synthetase  53.56 
 
 
446 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 
431 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 
431 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 
430 aa  439  1e-122  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  52.64 
 
 
438 aa  439  1e-122  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 
430 aa  440  1e-122  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 
430 aa  439  1e-122  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 
430 aa  440  1e-122  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
431 aa  439  1e-122  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.97035e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 
430 aa  439  1e-122  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1181  adenylosuccinate synthetase  50.78 
 
 
458 aa  440  1e-122  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  50.57 
 
 
445 aa  439  1e-122  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 
432 aa  439  1e-122  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 
430 aa  439  1e-122  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1101  adenylosuccinate synthetase  51 
 
 
458 aa  440  1e-122  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415884  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 
430 aa  439  1e-122  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 
432 aa  441  1e-122  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.30749e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
430 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 
430 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 
431 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.76094e-06  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 
429 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 
431 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.77348e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  52.22 
 
 
431 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  51.49 
 
 
444 aa  438  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 
432 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1162  adenylosuccinate synthetase  53.78 
 
 
446 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 
430 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  51.86 
 
 
431 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5009  adenylosuccinate synthetase  50.33 
 
 
458 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470264  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 
438 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>