116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0328 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  98.24 
 
 
397 aa  747  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  756  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  79.13 
 
 
397 aa  544  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  50.26 
 
 
403 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  44.13 
 
 
414 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  50.38 
 
 
401 aa  306  5e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  49.6 
 
 
408 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  51.45 
 
 
392 aa  299  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  43.52 
 
 
413 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  43.01 
 
 
413 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  51 
 
 
403 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  3.01222e-08 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  52.31 
 
 
392 aa  282  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  47.14 
 
 
409 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  47.12 
 
 
408 aa  270  3e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  44.74 
 
 
403 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  50.91 
 
 
392 aa  259  5e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  45.66 
 
 
394 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  46.08 
 
 
404 aa  254  2e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  42.5 
 
 
402 aa  245  1e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  45.41 
 
 
432 aa  243  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  45.29 
 
 
391 aa  234  2e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  48.44 
 
 
389 aa  229  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  42.56 
 
 
393 aa  221  2e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  40.62 
 
 
390 aa  211  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  46.32 
 
 
396 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  37.79 
 
 
398 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  39.03 
 
 
395 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  36.18 
 
 
401 aa  172  8e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  32.05 
 
 
406 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  2.07371e-09 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  32.82 
 
 
390 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  36.18 
 
 
401 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  38.52 
 
 
398 aa  169  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  32.58 
 
 
390 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.40024e-07  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  33.08 
 
 
390 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  38.34 
 
 
390 aa  163  5e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  33.75 
 
 
418 aa  163  5e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  33.25 
 
 
406 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  32.93 
 
 
403 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  32.34 
 
 
403 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  36.66 
 
 
401 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  37.02 
 
 
393 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  32.58 
 
 
400 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  34.6 
 
 
401 aa  155  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  30.73 
 
 
403 aa  155  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  36.48 
 
 
406 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  36.48 
 
 
398 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  36.48 
 
 
398 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  36.48 
 
 
398 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  32.11 
 
 
390 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  33.17 
 
 
414 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  32.55 
 
 
390 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  35.44 
 
 
396 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  34.94 
 
 
406 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  33 
 
 
401 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  32.29 
 
 
390 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  36.72 
 
 
398 aa  149  1e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  36.72 
 
 
398 aa  148  1e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  36.72 
 
 
398 aa  149  1e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  28.91 
 
 
394 aa  149  1e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  37.24 
 
 
424 aa  149  1e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  32.29 
 
 
422 aa  149  1e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  32.33 
 
 
394 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  32.18 
 
 
403 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  32.38 
 
 
390 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  32.75 
 
 
403 aa  146  8e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  7.03097e-08  decreased coverage  2.73343e-05 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  37.43 
 
 
399 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  29.88 
 
 
393 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  37.43 
 
 
391 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  29.75 
 
 
409 aa  142  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  37.34 
 
 
393 aa  142  1e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  37.31 
 
 
405 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  37.18 
 
 
393 aa  136  6e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  31.58 
 
 
403 aa  135  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  33.92 
 
 
389 aa  135  1e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  31.09 
 
 
403 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  34.16 
 
 
397 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  33.33 
 
 
409 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  33.04 
 
 
390 aa  131  2e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  33.04 
 
 
390 aa  131  2e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  31.9 
 
 
399 aa  131  2e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  30.61 
 
 
431 aa  132  2e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  29.87 
 
 
385 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  33.08 
 
 
394 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  35.28 
 
 
407 aa  122  1e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  34.38 
 
 
384 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  36.55 
 
 
403 aa  119  8e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  28.35 
 
 
428 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  35.42 
 
 
442 aa  115  1e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  38.42 
 
 
404 aa  115  1e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  35.42 
 
 
407 aa  115  2e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  35.42 
 
 
407 aa  115  2e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  35.42 
 
 
407 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  35.42 
 
 
407 aa  115  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  35.42 
 
 
407 aa  115  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2830  hypothetical protein  33.85 
 
 
409 aa  114  4e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  28.39 
 
 
388 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  38.68 
 
 
404 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  30.33 
 
 
400 aa  113  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1465  NnrS family protein  33.85 
 
 
409 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185105  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  34.73 
 
 
397 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>