37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0209 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0209  prophage Lp3 protein 18  100 
 
 		 184 aa  361  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2636  HK97 family phage prohead protease  75.66 
 
 		 183 aa  266  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00090927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2150  peptidase U35, phage prohead HK97  36.78 
 
 		 233 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2958  phage prohead protease, HK97 family  28.15 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  35.48 
 
 		 562 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  37.4 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  33.86 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  32.79 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  36.43 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  36.43 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  33.33 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2599  HK97 family phage prohead protease  33.33 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  30.53 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  30.53 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  29.63 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1679  phage prohead protease, HK97 family  31.47 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000321389  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  30.53 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  30 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  28.12 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  27.69 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  27.69 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  27.69 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  26.09 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  26.09 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  31.75 
 
 		 190 aa  50.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  26.81 
 
 		 236 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  32.26 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  28.69 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  31.16 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1683  phage phi-105 ORF26-like protein  31.29 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  35.04 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  35.04 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  31.33 
 
 		 696 aa  44.7  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  36.76 
 
 		 645 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  36.76 
 
 		 645 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  36.76 
 
 		 645 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  27.42 
 
 		 228 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>