218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0083 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  100 
 
 
128 aa  259  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  99.22 
 
 
128 aa  259  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  87.5 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  55.56 
 
 
130 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  53.17 
 
 
134 aa  121  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  47.33 
 
 
135 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0639  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.62 
 
 
121 aa  116  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  46.56 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  50.77 
 
 
139 aa  114  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  46.09 
 
 
132 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.03 
 
 
131 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0227  flagellar basal body rod protein FlgB  40.97 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.873509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  45.8 
 
 
135 aa  110  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  43.94 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  52.25 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  52.25 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  43.94 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  46.15 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.53 
 
 
135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  49.61 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.76 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  46.09 
 
 
136 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0719  flagellar basal body rod protein FlgB  38.31 
 
 
158 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  44.27 
 
 
135 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  42.42 
 
 
136 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.31 
 
 
133 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.6 
 
 
133 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0263  lateral flagellar rod protein LfgB  43.65 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3371  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.65 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  42.75 
 
 
135 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.91 
 
 
165 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  42.42 
 
 
136 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.88 
 
 
132 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  44.88 
 
 
138 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  45.9 
 
 
137 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.53 
 
 
139 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  44.88 
 
 
138 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  42.64 
 
 
132 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.97 
 
 
151 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.92 
 
 
130 aa  100  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.97 
 
 
151 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.22 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  42.31 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  44.72 
 
 
130 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  43.31 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  43.31 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  42.31 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  42.31 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  43.31 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  42.31 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  42.31 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  42.97 
 
 
132 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  42.15 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  44.72 
 
 
130 aa  98.2  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.75 
 
 
134 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.35 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  44.53 
 
 
138 aa  98.2  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4671  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.83 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0128148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.98 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.45 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.7 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  43.08 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.08 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  43.08 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  43.08 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  43.08 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  43.08 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  41.09 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1906  flagellar basal body rod protein FlgB  42.06 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.179452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  43.08 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  43.08 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  43.08 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  43.41 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.8 
 
 
117 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.792834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6371  flagellar basal body rod protein FlgB  38.62 
 
 
162 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232984  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  39.68 
 
 
135 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0075  flagellar basal body rod protein FlgB  42.15 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  44 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  40.31 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  39.31 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  38.36 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  42.42 
 
 
134 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2411  flagellar basal body rod protein FlgB  38.62 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  41.35 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  41.35 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3070  flagellar basal body rod protein FlgB  39.46 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3025  flagellar basal body rod protein FlgB  38.62 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0258442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2935  flagellar basal body rod protein FlgB  39.46 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000740  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.09 
 
 
120 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3044  flagellar basal body rod protein FlgB  38.62 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  41.67 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  38.19 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  38.19 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  38.19 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.86 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  38.19 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  38.19 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  38.19 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  38.19 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04909  flagellar basal body rod protein FlgB  39.52 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>