247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0082 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0082  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1718  flagellar basal-body rod protein FlgC  99.28 
 
 
138 aa  278  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1671  flagellar basal-body rod protein FlgC  92.03 
 
 
138 aa  263  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1270  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.28 
 
 
134 aa  130  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261409  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2908  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.38 
 
 
267 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.742895  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.88 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
137 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.3 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
138 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  40.3 
 
 
138 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
139 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
138 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
138 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
138 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
138 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
138 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  37.96 
 
 
138 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.3 
 
 
136 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  38.06 
 
 
138 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  38.06 
 
 
138 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  42.54 
 
 
138 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.96 
 
 
136 aa  100  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  38.19 
 
 
146 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.28 
 
 
134 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  38.19 
 
 
146 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
137 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.68 
 
 
143 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  36.55 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  38.64 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  37.41 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  38.64 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.54 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.35 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  37.93 
 
 
147 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  38.73 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.19 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.88 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  35.86 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  36.55 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.39 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 
138 aa  96.7  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1905  flagellar basal body rod protein FlgC  36.57 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  35.97 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  37.76 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  36.05 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3970  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.12 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.12 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.06 
 
 
146 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  37.06 
 
 
146 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.41 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  37.31 
 
 
138 aa  94.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.79 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.88 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.85 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.85 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3467  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.36 
 
 
138 aa  93.6  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 
135 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3715  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.6 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0207  flagellar basal body rod protein FlgC  38.57 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.662374 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.84 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.1 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.35 
 
 
135 aa  90.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.61 
 
 
139 aa  90.1  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  38.35 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.3 
 
 
134 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  38.35 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.31 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4672  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.53 
 
 
132 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  35.56 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.74 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  40.3 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.04 
 
 
140 aa  87  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0226  flagellar basal body rod protein FlgC  33.79 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.893505 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04910  flagellar basal body rod protein FlgC  32.62 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  41.79 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0720  flagellar basal body rod protein FlgC  33.79 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  32.17 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3577  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.86 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.2 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  40.3 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  40.3 
 
 
134 aa  84  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>