More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0080 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  99.76 
 
 		 423 aa  836    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 423 aa  838    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1669  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  90.78 
 
 		 423 aa  737    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  40.05 
 
 		 418 aa  294  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  41.18 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  39.27 
 
 		 453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  39.57 
 
 		 453 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  37.98 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  37.98 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  37.98 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  39.03 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  38.59 
 
 		 455 aa  275  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  38.32 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.64 
 
 		 435 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  39.14 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  39.66 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  39.61 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  38.28 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  38.93 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  37.69 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  37.39 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  39.17 
 
 		 407 aa  259  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  39.17 
 
 		 407 aa  259  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  37.82 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  38.53 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  36.86 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  36.95 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  37.01 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  37.39 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  36.24 
 
 		 434 aa  243  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  35.53 
 
 		 437 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  34.95 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  35.75 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  35.91 
 
 		 442 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.44 
 
 		 418 aa  233  7.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.76 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  36.99 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  32.57 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  33.78 
 
 		 437 aa  227  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  33.78 
 
 		 437 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  35.58 
 
 		 410 aa  226  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  32.36 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  35.34 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  34.19 
 
 		 401 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  34.66 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  33.19 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  31.8 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  34.77 
 
 		 440 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2335  flagellar hook protein FlgE  33.92 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 		 413 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 		 413 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 		 413 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 		 413 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 		 413 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 		 413 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  32.69 
 
 		 451 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  34.58 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  34.88 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.67 
 
 		 395 aa  207  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  33.11 
 
 		 413 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  33.11 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.7 
 
 		 426 aa  206  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  34.19 
 
 		 406 aa  206  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  33.72 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  31.85 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  32.88 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  31.85 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  32.88 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  36.6 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  34.5 
 
 		 398 aa  203  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.08 
 
 		 423 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  32.43 
 
 		 414 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  32.12 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  32.56 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  35.16 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  33.79 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  32.27 
 
 		 413 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  31.68 
 
 		 443 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  31.82 
 
 		 413 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  32.35 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  32.05 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  32.05 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  33.72 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  32.86 
 
 		 398 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  31.85 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  31.7 
 
 		 399 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  32.2 
 
 		 414 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  31.35 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  31.62 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  31.09 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  31.25 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  31.25 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  31.09 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  32.02 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>