More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0079 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0079  flagellar proximal rod protein FlgF  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1715  hypothetical protein  99.6 
 
 		 251 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1668  hypothetical protein  89.64 
 
 		 251 aa  454  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  37.45 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  36.65 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2911  flagellar basal-body rod FlgF  32.94 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  35.32 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004169  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.57 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  37.05 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.92 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.92 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  37.05 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  34.39 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  32.54 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  31.87 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  32.27 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  32.54 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  32.27 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  32.27 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  32.27 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  35.86 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.46 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0065  flagellar basal-body rod protein FlgF  36.08 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2334  flagellar basal body rod protein FlgF  34.48 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  35.46 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1267  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.2 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  32.41 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  32.54 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0629  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.65 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  31.47 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  31.87 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  32.14 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  32.14 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  30.83 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.47 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.47 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  30.68 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1501  flagellar basal body rod protein FlgF  35.32 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  31.08 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  32.93 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2314  flagellar basal body rod protein FlgF  31.2 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.222924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.85 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  32.8 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.39 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.07 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  30.71 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3647  flagellar basal-body rod FlgF  32.93 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  31.75 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3464  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.08 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3967  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.8 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  32.03 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  30.31 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  33.07 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3367  flagellar basal body rod protein FlgF  31.92 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  31.64 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  30.98 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0267  flagellar basal body rod protein FlgF  30.89 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.53 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1902  flagellar basal body rod protein FlgF  31.08 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101684 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  31.25 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01008  flagellar basal body rod protein FlgF  32.48 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06158  flagellar basal body rod protein FlgF  32.48 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00145829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1557  flagellar basal body rod protein  29.34 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.67 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0210  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.2 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1470  hypothetical protein  29.44 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  30.28 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  31.2 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0188  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.89 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.866674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1872  flagellar basal body rod protein FlgF  29.39 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2594  flagellar basal body rod protein FlgF  29.39 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  30.23 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  31.62 
 
 		 247 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  29.84 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  29.84 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  32.17 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  29.84 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  29.84 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  29.84 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  29.84 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  29.84 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  28.85 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  30.43 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0223  flagellar basal body rod protein FlgF  29.44 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0071  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.66 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  29.74 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0643  flagellar basal body rod protein FlgF  29.44 
 
 		 243 aa  95.1  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  30.43 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  31.87 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  30.42 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  28.26 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2966  flagellar basal body rod protein FlgF  32.17 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.754778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1974  flagellar basal-body rod FlgF  30.42 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2421  flagellar basal body rod protein FlgF  30.35 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.778215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>