253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0074 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  100 
 
 		 1363 aa  2569    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1663  flagellar hook-associated protein FlgK  72.16 
 
 		 1365 aa  1683    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  98.83 
 
 		 1363 aa  2541    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  28.63 
 
 		 624 aa  144  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  28.63 
 
 		 624 aa  144  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  32.26 
 
 		 652 aa  135  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  27.97 
 
 		 665 aa  133  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  28.95 
 
 		 638 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 641 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  27.4 
 
 		 637 aa  132  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.6 
 
 		 641 aa  131  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  27.61 
 
 		 631 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 641 aa  131  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  29.01 
 
 		 641 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 		 642 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 641 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  28.4 
 
 		 641 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  28.14 
 
 		 641 aa  129  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  28.49 
 
 		 641 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 		 645 aa  127  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 		 645 aa  127  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  29.93 
 
 		 549 aa  125  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  27.82 
 
 		 638 aa  125  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  32.12 
 
 		 477 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  26.5 
 
 		 642 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  30.69 
 
 		 640 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  30.34 
 
 		 626 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  27.85 
 
 		 554 aa  122  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  27.85 
 
 		 554 aa  122  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  30.99 
 
 		 456 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  27.85 
 
 		 554 aa  122  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  27.66 
 
 		 539 aa  121  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  29.51 
 
 		 657 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  29.98 
 
 		 657 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  29.49 
 
 		 680 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  30.15 
 
 		 457 aa  119  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  31.23 
 
 		 464 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  26.36 
 
 		 645 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  27.2 
 
 		 688 aa  118  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2916  flagellar hook-associated protein  35.89 
 
 		 441 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  28.36 
 
 		 659 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  28.79 
 
 		 641 aa  116  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  28.48 
 
 		 638 aa  115  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  27.38 
 
 		 640 aa  115  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  27.13 
 
 		 657 aa  114  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 		 640 aa  114  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  27.06 
 
 		 676 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  30.15 
 
 		 681 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  30.59 
 
 		 637 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  25.88 
 
 		 920 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  27.98 
 
 		 643 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  27.98 
 
 		 643 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  27.98 
 
 		 643 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  27.29 
 
 		 649 aa  114  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  26.16 
 
 		 639 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  30.45 
 
 		 647 aa  112  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  27.99 
 
 		 667 aa  112  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  31.13 
 
 		 477 aa  112  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  28.42 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  27.35 
 
 		 649 aa  111  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 631 aa  110  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  28.42 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  28.42 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  28.42 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  28.42 
 
 		 714 aa  111  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  28.42 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  25.38 
 
 		 547 aa  110  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1534  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 		 551 aa  110  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  27.02 
 
 		 568 aa  110  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  29.22 
 
 		 457 aa  109  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  27.05 
 
 		 541 aa  109  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  25.44 
 
 		 547 aa  108  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  25.44 
 
 		 547 aa  108  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  25.82 
 
 		 547 aa  108  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  25.44 
 
 		 547 aa  108  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  25.22 
 
 		 547 aa  107  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  25.44 
 
 		 547 aa  108  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 		 548 aa  108  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  25.44 
 
 		 547 aa  108  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  25.22 
 
 		 547 aa  107  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 		 640 aa  106  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  26.65 
 
 		 667 aa  106  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  24.83 
 
 		 546 aa  106  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 553 aa  106  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 553 aa  106  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 553 aa  106  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 553 aa  106  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 553 aa  106  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  33.87 
 
 		 619 aa  105  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  25.59 
 
 		 682 aa  104  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  27.11 
 
 		 665 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 665 aa  102  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  29.55 
 
 		 457 aa  102  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  25.41 
 
 		 683 aa  102  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  31.23 
 
 		 478 aa  102  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  27.8 
 
 		 660 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  29.13 
 
 		 386 aa  100  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1877  flagellar hook-associated protein FlgK  26.92 
 
 		 556 aa  100  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  27.53 
 
 		 683 aa  100  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 		 465 aa  100  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>