281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0053 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1688  flagellar M-ring protein FliF  99.12 
 
 		 570 aa  1100    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00646799  hitchhiker  0.000845587 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0053  flagellar FliF M-ring protein  100 
 
 		 570 aa  1106    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1641  flagellar M-ring protein FliF  88.64 
 
 		 572 aa  942    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178622  normal  0.771793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1287  flagellar M-ring protein FliF  34.69 
 
 		 578 aa  293  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.930135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  32.88 
 
 		 592 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  32.88 
 
 		 592 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  36.1 
 
 		 552 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  32.71 
 
 		 592 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2936  flagellar M-ring protein FliF  33.98 
 
 		 551 aa  259  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  34.31 
 
 		 567 aa  246  9e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  32.72 
 
 		 592 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 		 544 aa  243  6e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  31.64 
 
 		 594 aa  241  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  30.9 
 
 		 544 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  31.51 
 
 		 595 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  30.82 
 
 		 597 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  37.42 
 
 		 552 aa  240  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  30.49 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  31.64 
 
 		 594 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  37.45 
 
 		 580 aa  238  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  35.62 
 
 		 590 aa  237  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  37.19 
 
 		 561 aa  234  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  32.22 
 
 		 600 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  37.67 
 
 		 548 aa  233  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  35.68 
 
 		 595 aa  233  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 		 594 aa  230  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  33.73 
 
 		 566 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  34.99 
 
 		 567 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  32.4 
 
 		 593 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  35.97 
 
 		 568 aa  226  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  32.01 
 
 		 587 aa  226  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  34.67 
 
 		 558 aa  226  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  37.05 
 
 		 552 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  37.05 
 
 		 552 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  37.05 
 
 		 552 aa  226  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  37.05 
 
 		 552 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  37.05 
 
 		 562 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  37.05 
 
 		 552 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  36.94 
 
 		 552 aa  223  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 		 579 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 		 579 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 		 576 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 		 579 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  33.71 
 
 		 587 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  33.71 
 
 		 587 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  33.71 
 
 		 587 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 		 579 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  35.28 
 
 		 571 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  33.7 
 
 		 568 aa  221  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  35.16 
 
 		 603 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  32.16 
 
 		 565 aa  220  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  37.28 
 
 		 548 aa  220  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  32.58 
 
 		 587 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  32.58 
 
 		 587 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  35.7 
 
 		 587 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  33.2 
 
 		 556 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  35.81 
 
 		 566 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  36.09 
 
 		 598 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  36.09 
 
 		 598 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  36.09 
 
 		 598 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  35.1 
 
 		 560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  35.1 
 
 		 560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 		 574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  35.1 
 
 		 560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  32.21 
 
 		 584 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 		 574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  34.86 
 
 		 560 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  33.09 
 
 		 570 aa  213  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  33.09 
 
 		 570 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  35.4 
 
 		 677 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  32.96 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  35.47 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  36.81 
 
 		 576 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  35.47 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1361  flagellar MS-ring protein  32.66 
 
 		 566 aa  211  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  35.63 
 
 		 598 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  35.63 
 
 		 598 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  35.63 
 
 		 598 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  35.63 
 
 		 598 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  34.78 
 
 		 594 aa  210  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  35.11 
 
 		 563 aa  210  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  32.9 
 
 		 569 aa  209  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  34.71 
 
 		 568 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.75 
 
 		 611 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.75 
 
 		 611 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  35.13 
 
 		 588 aa  206  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  34.13 
 
 		 560 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  31.94 
 
 		 568 aa  206  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  32.91 
 
 		 558 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  34.27 
 
 		 563 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  33.63 
 
 		 565 aa  204  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  33.02 
 
 		 569 aa  203  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  32.92 
 
 		 558 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  32.98 
 
 		 576 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  34.61 
 
 		 566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3066  flagellar MS-ring protein  34.69 
 
 		 569 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  30.59 
 
 		 611 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1182  flagellar MS-ring protein  33.89 
 
 		 558 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  35.01 
 
 		 553 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1366  flagellar MS-ring protein  32.46 
 
 		 565 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>