More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0047 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0047  chemotaxis methylesterase, CheB2  100 
 
 
365 aa  705    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1682  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  99.45 
 
 
365 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201783  hitchhiker  0.00213648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1635  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  81.47 
 
 
382 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.989989  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  46.22 
 
 
353 aa  299  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.85 
 
 
354 aa  288  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  48.71 
 
 
363 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  43.6 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0665  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.2 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  0.470947 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  44.64 
 
 
350 aa  281  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02180  chemotaxis-specific methylesterase  51.37 
 
 
349 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.447797 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.56 
 
 
362 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2474  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.56 
 
 
362 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0236682  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  47.92 
 
 
364 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  46.24 
 
 
354 aa  279  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  45.13 
 
 
350 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  44.54 
 
 
355 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  48.95 
 
 
352 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  51.06 
 
 
349 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  44.06 
 
 
363 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  44.41 
 
 
350 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  42.69 
 
 
352 aa  276  4e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  42.86 
 
 
349 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  45 
 
 
350 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  44.71 
 
 
349 aa  276  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.61 
 
 
355 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.06 
 
 
353 aa  275  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  45.69 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1538  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.58 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.30172  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  46.84 
 
 
362 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  44.67 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.67 
 
 
349 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  44.67 
 
 
349 aa  272  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  44.41 
 
 
349 aa  272  7e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  44.41 
 
 
349 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  44.41 
 
 
349 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  45.22 
 
 
355 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  44.67 
 
 
349 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  43.43 
 
 
362 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  44.38 
 
 
359 aa  272  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  44.67 
 
 
349 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  44.67 
 
 
349 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  44.67 
 
 
349 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  44.67 
 
 
349 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  43.84 
 
 
356 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.59 
 
 
364 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1564  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.91 
 
 
355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.736792  normal  0.583275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2103  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.94 
 
 
349 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262545  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4820  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.54 
 
 
361 aa  269  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.305124  hitchhiker  0.00546369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.98 
 
 
363 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.24 
 
 
356 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.08 
 
 
371 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0781  chemotaxis-specific methylesterase  43.97 
 
 
358 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  44.08 
 
 
349 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  45.71 
 
 
354 aa  267  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2242  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.64 
 
 
349 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109495  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0615  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.22 
 
 
347 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0496998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.13 
 
 
365 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  44.51 
 
 
364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.51 
 
 
356 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.64 
 
 
349 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2359  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.64 
 
 
349 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289939  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0282  chemotaxis-specific methylesterase  47.24 
 
 
341 aa  265  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  44.67 
 
 
349 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  44.67 
 
 
349 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  43.39 
 
 
358 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  46.51 
 
 
357 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  43.75 
 
 
345 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  44.12 
 
 
356 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  44.02 
 
 
349 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  44.02 
 
 
349 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  44.02 
 
 
349 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0906  chemotaxis-specific methylesterase  46.58 
 
 
351 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0429  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.21 
 
 
361 aa  262  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41728  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.85 
 
 
365 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1428  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.12 
 
 
356 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  43.06 
 
 
363 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  43.06 
 
 
360 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  45.38 
 
 
349 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  43.79 
 
 
356 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4668  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  42.82 
 
 
368 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275647  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1611  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.17 
 
 
356 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  41.3 
 
 
375 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  41.3 
 
 
375 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  45.16 
 
 
356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3301  protein-glutamate methylesterase  43.14 
 
 
358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2213  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.06 
 
 
351 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  42.9 
 
 
359 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  43.06 
 
 
363 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.89 
 
 
348 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.73 
 
 
384 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0878  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.18 
 
 
378 aa  257  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0238  chemotaxis-specific methylesterase  45.95 
 
 
349 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  41.79 
 
 
362 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  42.57 
 
 
360 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  42.57 
 
 
360 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  42.57 
 
 
360 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0732  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.29 
 
 
350 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298385  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1443  chemotaxis-specific methylesterase  46.92 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  44.7 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.22 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>