89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0004 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0004  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  196  9e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  93.1 
 
 		 310 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  74.14 
 
 		 312 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  75.86 
 
 		 311 aa  93.2  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  74.14 
 
 		 311 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  70.69 
 
 		 311 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  70.69 
 
 		 310 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  67.24 
 
 		 313 aa  88.6  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  67.24 
 
 		 314 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  70 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  62.3 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  59.02 
 
 		 305 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  55.88 
 
 		 305 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  60.34 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  61.02 
 
 		 306 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  60.29 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  59.02 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  59.02 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  60.29 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  63.49 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  43.82 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  42.7 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  60.29 
 
 		 312 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  53.45 
 
 		 306 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  42.53 
 
 		 318 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  59.02 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  55.17 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  61.9 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  51.43 
 
 		 298 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  67.5 
 
 		 304 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  52.94 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  60.98 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  64.29 
 
 		 307 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  58.14 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  59.52 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  61.9 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  57.14 
 
 		 289 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  59.52 
 
 		 307 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  44.12 
 
 		 297 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  55.56 
 
 		 296 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  63.89 
 
 		 296 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  57.5 
 
 		 294 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  52.27 
 
 		 291 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  61.11 
 
 		 294 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  40.91 
 
 		 299 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  52.27 
 
 		 291 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  39.39 
 
 		 307 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  32.88 
 
 		 296 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  42.03 
 
 		 296 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  42.22 
 
 		 293 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  42.55 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  43.08 
 
 		 298 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  56.41 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  42.55 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  43.59 
 
 		 287 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  45.16 
 
 		 294 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  35.94 
 
 		 307 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  35.94 
 
 		 307 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  35.94 
 
 		 307 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  47.5 
 
 		 294 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  35.94 
 
 		 307 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  47.5 
 
 		 294 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  47.5 
 
 		 297 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  42.86 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  42.86 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  42.86 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  42.86 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  42.86 
 
 		 340 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  44.19 
 
 		 293 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  35.94 
 
 		 307 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  41.86 
 
 		 291 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  35.94 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  45 
 
 		 294 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  45 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  42.86 
 
 		 293 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  35.94 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  45 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  45 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  43.59 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  25.68 
 
 		 297 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  41.86 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  43.59 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  38.03 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  37.68 
 
 		 304 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  34.38 
 
 		 307 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  41.07 
 
 		 316 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>