142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05701 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  95.89 
 
 
3501 aa  5517    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  35.16 
 
 
3322 aa  798    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  100 
 
 
3552 aa  6950    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  35.46 
 
 
3131 aa  1031    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  34.68 
 
 
3141 aa  970    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  36.66 
 
 
3301 aa  835    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  60.4 
 
 
2984 aa  2399    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.22 
 
 
3020 aa  1334    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  52.63 
 
 
3004 aa  830    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  56.06 
 
 
3028 aa  2368    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  35.59 
 
 
3144 aa  1086    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  35.59 
 
 
3141 aa  1081    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  42.85 
 
 
3159 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  34.53 
 
 
3141 aa  963    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  59.46 
 
 
3079 aa  2494    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.77 
 
 
2782 aa  744    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.84 
 
 
5981 aa  583  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0071  hemagglutinin-related protein  58.12 
 
 
541 aa  506  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  28.67 
 
 
3526 aa  486  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.17 
 
 
3602 aa  466  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  34.12 
 
 
3165 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  32.99 
 
 
3081 aa  416  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.83 
 
 
3128 aa  404  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  28.71 
 
 
4966 aa  393  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  29.49 
 
 
2758 aa  375  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  33 
 
 
5212 aa  371  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  33.39 
 
 
3563 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  32.89 
 
 
3350 aa  368  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  33.16 
 
 
3443 aa  363  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  33.1 
 
 
6274 aa  360  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.14 
 
 
2421 aa  359  5.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.17 
 
 
3785 aa  355  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.93 
 
 
2545 aa  355  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  37.93 
 
 
2588 aa  354  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  37.42 
 
 
2530 aa  353  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.64 
 
 
2600 aa  342  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.8 
 
 
658 aa  340  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  38.88 
 
 
2345 aa  340  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.44 
 
 
3475 aa  324  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.88 
 
 
3040 aa  285  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  41.04 
 
 
594 aa  274  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.66 
 
 
3790 aa  273  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.27 
 
 
3967 aa  272  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  43.52 
 
 
3884 aa  271  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  35.89 
 
 
1998 aa  268  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.14 
 
 
3796 aa  265  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.53 
 
 
2670 aa  264  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.8 
 
 
1730 aa  259  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.93 
 
 
3862 aa  258  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  35.29 
 
 
710 aa  241  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  33.08 
 
 
812 aa  224  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  29.23 
 
 
3147 aa  218  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  31.47 
 
 
2061 aa  213  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  46.85 
 
 
1723 aa  209  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  31.18 
 
 
3300 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  29.98 
 
 
2737 aa  201  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  31.54 
 
 
1268 aa  199  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  33.55 
 
 
1077 aa  197  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  31.35 
 
 
2904 aa  193  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.64 
 
 
2827 aa  191  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  28.07 
 
 
1270 aa  185  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.65 
 
 
2818 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  31.63 
 
 
2536 aa  177  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.9 
 
 
428 aa  175  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.36 
 
 
3480 aa  172  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.96 
 
 
923 aa  172  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  28.99 
 
 
991 aa  171  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.03 
 
 
2847 aa  171  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02977  filamentous haemagglutinin  30.47 
 
 
857 aa  171  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40 
 
 
3378 aa  170  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.9 
 
 
721 aa  169  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  31.21 
 
 
1841 aa  167  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  35.82 
 
 
2449 aa  166  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.88 
 
 
2666 aa  164  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  30.53 
 
 
3929 aa  157  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  38.62 
 
 
1489 aa  156  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.3 
 
 
2786 aa  155  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  33.44 
 
 
1719 aa  153  7e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  37.17 
 
 
2350 aa  152  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  28.11 
 
 
1571 aa  152  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  34.99 
 
 
1038 aa  150  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  35.32 
 
 
915 aa  149  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  29.66 
 
 
2691 aa  147  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  29.7 
 
 
1052 aa  141  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  37 
 
 
848 aa  140  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  23.23 
 
 
2651 aa  133  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0521  hypothetical protein  37.27 
 
 
412 aa  133  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.718593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  28.55 
 
 
2751 aa  132  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.4 
 
 
847 aa  131  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  30.58 
 
 
1618 aa  131  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  30.77 
 
 
846 aa  129  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  26.73 
 
 
2964 aa  129  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  35.86 
 
 
716 aa  127  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3272  hypothetical protein  31.63 
 
 
763 aa  127  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1521  hypothetical protein  35.5 
 
 
397 aa  127  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.22 
 
 
1615 aa  125  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  30.19 
 
 
905 aa  124  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  30.19 
 
 
905 aa  124  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  29.57 
 
 
914 aa  124  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.46 
 
 
1508 aa  124  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>