86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05544 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05544  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  147  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3781  hypothetical protein  57.75 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.519742  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4582  hypothetical protein  57.75 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.213587  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3742  addiction module killer protein  57.75 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655044 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1253  addiction module killer protein  64.62 
 
 		 98 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2313  hypothetical protein  57.75 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5508  hypothetical protein  56.34 
 
 		 109 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3673  addiction module killer protein  56.34 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3154  addiction module killer protein  58.82 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4951  addiction module killer protein  57.75 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2823  addiction module killer protein  50.72 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.299861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1221  addiction module killer protein  56.52 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.958057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0419  hypothetical protein  58.06 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.366932  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2533  hypothetical protein  52.17 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000474289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0450  hypothetical protein  54.1 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0910099  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6940  hypothetical protein  57.35 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2739  hypothetical protein  51.43 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1814  hypothetical protein  51.43 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0569  addiction module killer protein  52.17 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.443198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0172  addiction module killer protein  57.35 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916333  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2689  hypothetical protein  51.43 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2208  addiction module killer protein  52.17 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.63367  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0568  hypothetical protein  50.72 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4221  hypothetical protein  53.03 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36110  hypothetical protein  56.06 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3175  addiction module killer protein  56.52 
 
 		 100 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40600  hypothetical protein  52.94 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2536  hypothetical protein  55.74 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2008  hypothetical protein  52.94 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0862  hypothetical protein  56.45 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622779  normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3266  addiction module killer protein  54.55 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0457  hypothetical protein  56.92 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8269  addiction module killer protein  50 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2958  hypothetical protein  50.68 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  0.740348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1183  hypothetical protein  51.52 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4138  hypothetical protein  51.52 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0172764  normal  0.111049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0899  addiction module killer protein  51.35 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3001  addiction module killer protein  49.25 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2671  hypothetical protein  51.43 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171981  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4948  addiction module killer protein  44.44 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583991  normal  0.477972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4036  addiction module killer protein  47.22 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0225  hypothetical protein  52.94 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3081  hypothetical protein  53.62 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0277  putative addiction module killer protein  51.52 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3122  hypothetical protein  53.85 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0607  addiction module killer protein  53.12 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4469  hypothetical protein  52.31 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0041  addiction module killer protein  47.83 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3349  hypothetical protein  51.35 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000920139  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4549  addiction module killer protein  51.61 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0367  addiction module killer protein  51.61 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.247793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2241  addiction module killer protein  43.06 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3599  hypothetical protein  54.1 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6312  addiction module killer protein  48.53 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0289736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0236  addiction module killer protein  47.06 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1444  hypothetical protein  47.14 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2516  hypothetical protein  54.1 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.726824  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6456  addiction module killer protein  53.33 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3921  addiction module killer protein  52.46 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4242  addiction module killer protein  51.67 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1302  addiction module killer protein  41.89 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3503  addiction module killer protein  54.1 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149451  hitchhiker  0.00969032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4612  addiction module killer protein  53.45 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5334  hypothetical protein  54.1 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4762  addiction module killer protein  51.67 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0501  hypothetical protein  50.85 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0016  probable addiction module killer protein  46.88 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0570  addiction module killer protein  50 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  unclonable  0.00000000000132448  unclonable  2.98787e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1687  addiction module killer protein  42.86 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0185  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4017  hypothetical protein  45.59 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1331  addiction module killer protein  57.45 
 
 		 48 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0428301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2122  addiction module killer protein  46.15 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0855  addiction module killer protein  50.82 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503668  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0050  addiction module killer protein  39.13 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3988  hypothetical protein  52 
 
 		 51 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5374  hypothetical protein  39.39 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000336277  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1307  hypothetical protein  33.85 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000276635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0684  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00337855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2734  addiction module killer protein  42.62 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0084  hypothetical protein  44.26 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.033356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3915  hypothetical protein  46.55 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1245  addiction module killer protein  39.34 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3745  addiction module killer protein  40.32 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117851  hitchhiker  0.00174099 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.204816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1427  hypothetical protein  39.22 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0167884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>