More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05325 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  69.93 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  66.67 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  68.24 
 
 		 312 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  67.91 
 
 		 312 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  68.24 
 
 		 312 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  67.44 
 
 		 316 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  67.11 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  60.84 
 
 		 308 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  53.16 
 
 		 308 aa  292  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  53.16 
 
 		 302 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  53.16 
 
 		 302 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  53.16 
 
 		 302 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  53.16 
 
 		 302 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  53.16 
 
 		 302 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  53.16 
 
 		 302 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  53.16 
 
 		 302 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0298  fructokinase, putative  53.36 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  51.84 
 
 		 302 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  51.17 
 
 		 302 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  50.84 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  52.51 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  51.84 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  51.84 
 
 		 302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  51.84 
 
 		 302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  52.17 
 
 		 302 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  50.17 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  50.91 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  32.46 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  35.2 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  35.24 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  33.75 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  35.28 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  35.28 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  33.76 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  32.91 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  32.62 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  34.49 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  32.26 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  32.69 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  31.39 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  34.62 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  35.31 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  33.58 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  31.72 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  32.5 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  31.61 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.57 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  33.44 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  32.03 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  31.4 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.13 
 
 		 311 aa  99.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  31.55 
 
 		 322 aa  99  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  33.97 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  30.89 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  31.49 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  28.89 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.76 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.18 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  31.4 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  31.94 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.42 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  33.44 
 
 		 310 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  33.58 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  34.56 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  30.32 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.41 
 
 		 319 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.41 
 
 		 319 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  29.9 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  34.07 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0544  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 331 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  33.44 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  31.35 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.63 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  30.97 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.48 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.86 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  31.68 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  31.3 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.45 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  24.38 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.72 
 
 		 313 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.72 
 
 		 313 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.72 
 
 		 313 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  31.3 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  24.38 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  31.75 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.78 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  32.78 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  31.55 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  26.56 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>