146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05320 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05320  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0866851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1473  hypothetical protein  82.24 
 
 		 111 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4944  hypothetical protein  79.09 
 
 		 110 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.300598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1160  hypothetical protein  78.5 
 
 		 110 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1172  hypothetical protein  78.5 
 
 		 110 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0240568  normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1254  hypothetical protein  82.24 
 
 		 110 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0263746  normal  0.108455 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4425  hypothetical protein  79.44 
 
 		 110 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1283  hypothetical protein  80.37 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000413611  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0802  hypothetical protein  80.37 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  71.3 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4243  protein of unknown function UPF0060  84.26 
 
 		 110 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4131  protein of unknown function UPF0060  84.26 
 
 		 110 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344067  normal  0.23278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  66.36 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  67.59 
 
 		 111 aa  141  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  62.73 
 
 		 110 aa  135  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2268  hypothetical protein  83.18 
 
 		 111 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  67.62 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2037  hypothetical protein  77.57 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  60.91 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  70 
 
 		 110 aa  133  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  62.04 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  64.81 
 
 		 110 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  69 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  62.73 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  62.86 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  63.81 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  62.96 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  63.81 
 
 		 106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  65 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  62.96 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  64 
 
 		 117 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  63 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  60.95 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  60 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  61.11 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01551  hypothetical protein  62 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2061  protein of unknown function UPF0060  62 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151826  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0342  hypothetical protein  71.96 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01541  hypothetical protein  62 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1655  hypothetical protein  62 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0427679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1789  hypothetical protein  62 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.477899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2048  hypothetical protein  62 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.791171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1618  hypothetical protein  61 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2291  hypothetical protein  59.8 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  hitchhiker  0.000000000030396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1598  protein of unknown function UPF0060  62 
 
 		 110 aa  123  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0157763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2289  hypothetical protein  64 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.616642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1931  hypothetical protein  58 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0387347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  62.86 
 
 		 222 aa  118  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2746  hypothetical protein  63.37 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304303  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1674  hypothetical protein  61.76 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1668  hypothetical protein  61.76 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1606  hypothetical protein  61.76 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1615  hypothetical protein  61.76 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1835  hypothetical protein  59.8 
 
 		 108 aa  105  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.132551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2792  hypothetical protein  78.85 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0343733  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  55.34 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0761  hypothetical protein  79.81 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945132  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3077  protein of unknown function UPF0060  69.57 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0586655 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1597  hypothetical protein  79.81 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1271  hypothetical protein  79.81 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.466479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0598  hypothetical protein  79.81 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1494  hypothetical protein  79.81 
 
 		 139 aa  95.9  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0554  hypothetical protein  79.81 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  54.46 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  53.47 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1464  hypothetical protein  79.81 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  51.49 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  52.48 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2889  protein of unknown function UPF0060  53.12 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  hitchhiker  0.00858506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  45.28 
 
 		 107 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1837  hypothetical protein  47.52 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01651  membrane protein YnfA  67.8 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  45.54 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  40.35 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  40.57 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  43.75 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4105  hypothetical protein  48 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  49.02 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  42.2 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  42 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2837  protein of unknown function UPF0060  56.25 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.578312  normal  0.331063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0666  hypothetical protein  41.82 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2230  hypothetical protein  43.56 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  37.27 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  41.28 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  42.2 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0659  hypothetical protein  55.45 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  37.84 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1789  hypothetical protein  53.33 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3474  protein of unknown function UPF0060  40.54 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2370  hypothetical protein  50.94 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0436  hypothetical protein  53.33 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0715  hypothetical protein  38.53 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  42.2 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  40.37 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  41 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  39.09 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  40.95 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7600  membrane protein  38.53 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>