More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05068 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  100 
 
 
676 aa  1340    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  85.37 
 
 
631 aa  1040    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  82.99 
 
 
678 aa  1072    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
1297 aa  357  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 
1331 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 
889 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 
708 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
1478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.27 
 
 
865 aa  326  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
680 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.17 
 
 
1501 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  45.03 
 
 
678 aa  320  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.75 
 
 
701 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
696 aa  318  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
934 aa  316  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 
1391 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.04 
 
 
1548 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 
1002 aa  313  4.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 
720 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 
1557 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.19 
 
 
697 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  42.89 
 
 
1399 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
882 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
796 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 
653 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.07 
 
 
1330 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 
955 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.44 
 
 
662 aa  294  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.7 
 
 
1419 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.07 
 
 
1431 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  40.67 
 
 
1131 aa  292  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.79 
 
 
1407 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
1808 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
519 aa  287  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
1287 aa  287  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  46.65 
 
 
725 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.32 
 
 
1068 aa  284  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
1965 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
606 aa  280  7e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.18 
 
 
1184 aa  277  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
1085 aa  273  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 
660 aa  272  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 
585 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
794 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
794 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  47.06 
 
 
459 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
587 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
656 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
666 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
666 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.4 
 
 
1214 aa  257  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44 
 
 
1220 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
663 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
689 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
652 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
664 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
672 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 
653 aa  247  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
657 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
657 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
663 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.93 
 
 
1380 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
652 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  36.11 
 
 
796 aa  241  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  35.38 
 
 
769 aa  241  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
781 aa  240  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  38.39 
 
 
771 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  38.39 
 
 
772 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  38.39 
 
 
771 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  38.39 
 
 
771 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  38.39 
 
 
771 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  38.39 
 
 
771 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 
646 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
768 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
768 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
768 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
768 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.74 
 
 
1361 aa  233  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
703 aa  233  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
663 aa  233  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
1165 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
835 aa  231  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
770 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
1559 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  38.84 
 
 
1384 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
654 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
799 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 
696 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.54 
 
 
772 aa  224  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1922  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 
558 aa  223  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
1287 aa  223  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
1333 aa  223  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  34.27 
 
 
810 aa  223  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
776 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1997  histidine kinase/response regulator hybrid protein  43.6 
 
 
558 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.947527  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
930 aa  221  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.97 
 
 
1255 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
939 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
806 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>