More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05067 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  813    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  87.09 
 
 		 432 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  87.09 
 
 		 432 aa  674    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  69.86 
 
 		 415 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  68.03 
 
 		 419 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  62.03 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  53.79 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  56.05 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  58.02 
 
 		 403 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  50.75 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  57.53 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  54.77 
 
 		 406 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  58.27 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  53.69 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  54.88 
 
 		 409 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  54.88 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  56.78 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  54.88 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  55.75 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  53.62 
 
 		 420 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  60.85 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  53.62 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  55.98 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  53.16 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  55.92 
 
 		 410 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  54.43 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  53.37 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  52.67 
 
 		 416 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  52.67 
 
 		 416 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  52.58 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  52.58 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  52.33 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  55.22 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  52.66 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  54.85 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  57.29 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  54.61 
 
 		 411 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  55.33 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  55.33 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  56.03 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  54.82 
 
 		 408 aa  364  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 		 416 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  53.03 
 
 		 416 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  54.72 
 
 		 421 aa  360  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  49.49 
 
 		 411 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  55.08 
 
 		 404 aa  359  6e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 415 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  57.45 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  51.53 
 
 		 408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  48.62 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  50.97 
 
 		 413 aa  341  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  48.7 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  44.52 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  48.27 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  43.91 
 
 		 433 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  49.1 
 
 		 412 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 429 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  46.67 
 
 		 454 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  45.02 
 
 		 414 aa  299  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  48.24 
 
 		 412 aa  297  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  42.68 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  43 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  44.82 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  47.42 
 
 		 455 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 499 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 427 aa  269  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  41.3 
 
 		 421 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 427 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  40.05 
 
 		 427 aa  259  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  36.34 
 
 		 424 aa  259  8e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  40.77 
 
 		 407 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 416 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 401 aa  242  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  38.15 
 
 		 414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 		 415 aa  239  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  39.52 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 415 aa  223  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 445 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 474 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  33.51 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 447 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 418 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>