270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04774 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  686    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  686    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  77.67 
 
 		 319 aa  524  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  76.49 
 
 		 319 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  77.04 
 
 		 319 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  77.36 
 
 		 319 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  75.69 
 
 		 339 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  76.42 
 
 		 319 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  76.73 
 
 		 319 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  78.68 
 
 		 319 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  76.42 
 
 		 319 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  75.08 
 
 		 339 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  78.68 
 
 		 319 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  76.42 
 
 		 336 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  76.42 
 
 		 319 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  76.42 
 
 		 319 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  75.79 
 
 		 319 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  63.09 
 
 		 321 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  62.92 
 
 		 329 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  60.69 
 
 		 318 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  60.56 
 
 		 321 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  60.38 
 
 		 318 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  60.38 
 
 		 318 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  60.38 
 
 		 318 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  60.38 
 
 		 318 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  60.38 
 
 		 318 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  60.38 
 
 		 318 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  60.38 
 
 		 318 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  57.7 
 
 		 332 aa  384  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  56.75 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  57.99 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  57.37 
 
 		 317 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  56.11 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  56.74 
 
 		 316 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  56.11 
 
 		 316 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  57.05 
 
 		 317 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  55.97 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  55.97 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  54.86 
 
 		 319 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  53.14 
 
 		 316 aa  351  8e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  53.61 
 
 		 316 aa  350  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  54.69 
 
 		 316 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  51.42 
 
 		 321 aa  318  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  61.98 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  49.84 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 319 aa  292  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.69 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  48.6 
 
 		 320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  45.79 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  43.93 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  33.2 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.62 
 
 		 287 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  34.25 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  30.12 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.96 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  34.51 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  31.48 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  30.47 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  26.2 
 
 		 438 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  28.16 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  25.29 
 
 		 300 aa  92.8  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  29.84 
 
 		 637 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  30.62 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.82 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  28.15 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1030  metallo-beta-lactamase family protein  30.16 
 
 		 282 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00771484  hitchhiker  0.000295307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  31.31 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  32.83 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  27.69 
 
 		 644 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  29.34 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  29.1 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 		 591 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  27.7 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>