203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03732 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  100 
 
 
375 aa  725    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  79.73 
 
 
395 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  79.73 
 
 
395 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  59.04 
 
 
368 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  31.3 
 
 
377 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  29.33 
 
 
383 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  31.98 
 
 
367 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  32.98 
 
 
333 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  29.09 
 
 
353 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  34.39 
 
 
383 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  29.64 
 
 
346 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  32.06 
 
 
340 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  31.15 
 
 
374 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  33.14 
 
 
344 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  32.17 
 
 
360 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  32.26 
 
 
340 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  35.08 
 
 
338 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  33.51 
 
 
344 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  36.31 
 
 
340 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  32.88 
 
 
351 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  27.64 
 
 
359 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  36.8 
 
 
363 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  31.58 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  31.81 
 
 
364 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  34.38 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  30.5 
 
 
342 aa  92.8  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  29.97 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  29.78 
 
 
339 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  31.93 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  32.84 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  31.78 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  30.15 
 
 
367 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  30.11 
 
 
362 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  30.27 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  31.17 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  26.22 
 
 
348 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  31.55 
 
 
354 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  32.98 
 
 
366 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  33.6 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  30.77 
 
 
327 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  30.31 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  26.62 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  38.29 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  29.22 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  29.64 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  30 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  29.4 
 
 
354 aa  77  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  30.75 
 
 
351 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  30.41 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  31.37 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  28.74 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  29.97 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  28.03 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  33.42 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  33.79 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  29.97 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  34.57 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  32.48 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  25.6 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6254  acyltransferase 3  30.67 
 
 
385 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  29.53 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  23.37 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  28.66 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  33.33 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  28.12 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  31.58 
 
 
376 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  31.92 
 
 
681 aa  63.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  32.08 
 
 
682 aa  62.8  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1965  acyltransferase family protein  27.35 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  30.41 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  28 
 
 
350 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  28.92 
 
 
430 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  28.36 
 
 
380 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  28.06 
 
 
656 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  29.01 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  28.21 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  27.27 
 
 
363 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  27.88 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  29.02 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  25.61 
 
 
382 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  28.57 
 
 
401 aa  56.2  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  28.1 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  30.18 
 
 
662 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  31.9 
 
 
349 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  28.27 
 
 
658 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  29.75 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  31.02 
 
 
362 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  26.96 
 
 
363 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  26.29 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  32.24 
 
 
364 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  26.58 
 
 
375 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  26.58 
 
 
375 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  28.94 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  28.22 
 
 
366 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0052  hypothetical protein  24.45 
 
 
592 aa  53.1  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000983267  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  23.64 
 
 
354 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  28.57 
 
 
742 aa  52.8  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  31.73 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  25.75 
 
 
629 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  38.64 
 
 
366 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>