123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03727 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03727  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.711116  normal  0.804887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4521  hypothetical protein  56.14 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1605  MbtH domain-containing protein  49.28 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959618  hitchhiker  0.000698475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3058  MbtH domain protein  52.73 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4779  MbtH-like protein  47.83 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338801  normal  0.320193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1551  MbtH domain-containing protein  49.28 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.352546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1960  MbtH domain-containing protein  57.41 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0748992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1365  MbtH domain protein  51.61 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.030882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1153  MbtH-like protein  47.83 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00754352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1633  MbtH domain-containing protein  47.83 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1608  MbtH domain-containing protein  47.83 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  0.0585682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1530  MbtH domain-containing protein  47.83 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3672  MbtH domain protein  57.41 
 
 		 195 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2269  MbtH-like protein  51.67 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4046  MbtH domain-containing protein  54.55 
 
 		 77 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.616337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0352  MbtH domain-containing protein  56.36 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0392661  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18430  hypothetical protein  57.69 
 
 		 72 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3808  MbtH domain protein  56.36 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300809  normal  0.380887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2137  MbtH-like protein  54.55 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.868752  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0518  hypothetical protein  49.25 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1860  MbtH domain protein  48.44 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1961  MbtH domain-containing protein  56.36 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00784539  normal  0.28542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2108  MbtH domain-containing protein  56.36 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.358481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2083  MbtH domain-containing protein  56.36 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1947  MbtH-like protein  54.55 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1835  MbtH-like protein  55.56 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.611677  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50380  MbtH-like protein  49.15 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0768073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2422  hypothetical protein  48.48 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0762914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4064  MbtH domain protein  50.91 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25630  MbtH-like protein  52.73 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3931  MbtH-like protein  54.55 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1834  MbtH domain protein  46.88 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1118  mbtH-like protein  52.73 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.899157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0270  mbtH-like protein-related protein  52.73 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0120  mbtH-like protein  52.73 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0306  mbtH-like protein  52.73 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1793  MbtH protein  52.73 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1707  MbtH protein  52.73 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.498691  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1289  MbtH protein  52.73 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2699  MbtH-like protein  48.48 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4421  MbtH domain-containing protein  49.15 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898543  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2864  MbtH domain-containing protein  51.85 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00522956  normal  0.0278723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1084  hypothetical protein  51.85 
 
 		 76 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4896  MbtH domain-containing protein  49.15 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2109  MbtH domain-containing protein  46.77 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6841  MbtH domain-containing protein  55.56 
 
 		 59 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2200  hypothetical protein  57.69 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33510  hypothetical protein  54.55 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0492469  normal  0.031748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2847  hypothetical protein  54.55 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4593  MbtH domain protein  50.85 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4600  MbtH domain protein  54.55 
 
 		 73 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1889  MbtH domain protein  55.56 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00160343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02560  hypothetical protein  58.49 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2787  MbtH domain-containing protein  51.85 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4502  MbtH domain protein  52.73 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3579  MbtH domain protein  54.55 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0192329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4563  MbtH domain-containing protein  55.77 
 
 		 71 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4320  MbtH domain protein  47.62 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5064  MbtH domain protein  53.85 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1861  MbtH-like protein  49.06 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2451  MbtH-like protein  50 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0351504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1190  mbtH-like protein  52 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.654142  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1633  mbtH domain-containing protein  52 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.11121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0296  mbtH domain-containing protein  52 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.533602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1918  hypothetical protein  52 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1932  mbtH domain-containing protein  52 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37654  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0865  mbtH domain-containing protein  52 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4111  hypothetical protein  55.1 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12402  putative mycobactin/exochelin synthesis protein mbtH  54.72 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0026  MbtH domain-containing protein  47.27 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3446  MbtH domain protein  50.94 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151007 
 
 
-
 
NC_003296  RS05513  hypothetical protein  52.63 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.141267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2426  mbtH-like protein  52 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.897448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1321  MbtH domain protein  50 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000806125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3875  MbtH domain protein  45.9 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.043442  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5943  MbtH domain-containing protein  49.09 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4760  MbtH domain-containing protein  51.85 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6555  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260663  hitchhiker  0.0000111172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1863  putative protein MbtH  50 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00579415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3474  MbtH domain-containing protein  50 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702242  hitchhiker  0.00496373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3731  MbtH domain protein  51.92 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5063  MbtH domain protein  50.94 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3842  MbtH domain-containing protein  50.94 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2077  mbtH-like protein  50 
 
 		 82 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2147  mbtH-like protein  43.64 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000104441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3740  MbtH domain protein  50 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3463  MbtH-like protein  48.15 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.176384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4310  MbtH domain protein  50 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3526  MbtH domain-containing protein  48.15 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0765133  normal  0.152032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5581  hypothetical protein  48.15 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.89349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3469  hypothetical protein  48.08 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00443864  hitchhiker  0.0033458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6969  hypothetical protein  47.27 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3985  MbtH domain protein  48.21 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3601  MbtH domain protein  48.08 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3716  MbtH domain protein  50 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3059  MbtH domain-containing protein  48.28 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4807  MbtH domain protein  47.17 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1759  MbtH domain-containing protein  41.07 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1743  MbtH domain protein  46.15 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2987  mbtH-like protein  41.07 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>