90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03174 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03174  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  258  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  79.03 
 
 		 127 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1693  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  79.03 
 
 		 127 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1665  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  79.03 
 
 		 127 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4854  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  79.03 
 
 		 127 aa  205  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0294126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1601  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  78.23 
 
 		 127 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1623  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  77.42 
 
 		 127 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0844226  normal  0.672862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2595  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.61 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1553  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  78.86 
 
 		 127 aa  197  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.111375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3893  glyoxalase, putative  76.8 
 
 		 129 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.85 
 
 		 130 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  76.19 
 
 		 130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0767303  normal  0.10787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4038  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.54 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3266  putative metallothiol transferase  72 
 
 		 126 aa  187  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4115  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.16 
 
 		 127 aa  176  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.726445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2987  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.29 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.382223  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.8 
 
 		 125 aa  157  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.68 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52890  ring-cleaving dioxygenase  64.23 
 
 		 126 aa  153  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1322  hypothetical protein  56.1 
 
 		 127 aa  153  9e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.1 
 
 		 127 aa  153  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2721  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.2 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.2 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.2 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000365872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4634  ring-cleaving dioxygenase  63.93 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.16 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1734  glyoxalase family protein  55.74 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.56 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.32 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.781159  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.02 
 
 		 125 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1277  hitchhiker  0.00852425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.28 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.28 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.823568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1574  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.28 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.28 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1001  extradiol ring-cleaving dioxygenase, putative  53.28 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2401  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.41 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2351  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.41 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0943  putative extradiol ring-cleaving dioxygenase  53.28 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.41 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1338  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.46 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.184325  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1528  hypothetical protein  50.41 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0872  glyoxalase family protein  51.61 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.72 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.468879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3172  glyoxalase family protein  53.72 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.139884  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2800  glyoxalase family protein  53.72 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.72 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.780094  hitchhiker  0.00163116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0045  ring-cleaving dioxygenase  52.94 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.985794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.03 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.08 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0851141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2211  30S ribosomal protein S15  41.27 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1815  putative ring-cleaving dioxygenase  49.48 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00491461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4030  hypothetical protein  40.62 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0866  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.52 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02088  hypothetical protein  57.75 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2716  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.02 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4553  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.79 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2855  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3017  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7861  hypothetical protein  39.69 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.5 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.32 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458223  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.5 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187371 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003185  hypothetical protein  42.11 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003189  hypothetical protein  42.11 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003199  hypothetical protein  43.16 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.67 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  36.97 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0964  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.07 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3833  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.83 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1729  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.65 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0037  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.2 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1685  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.86 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0848  hypothetical protein  30.95 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2248  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.06 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.887282  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.8 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1250  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6216  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.78 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02089  hypothetical protein  56.25 
 
 		 44 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4282  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  30.47 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.594556  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4214  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1705  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  31.25 
 
 		 325 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal  0.870304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4481  putative lactoylglutathione lyase  28.57 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298655  unclonable  0.00000133457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127452  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3592  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  31.25 
 
 		 325 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318937  normal  0.834201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4015  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.28 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.328603  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2568  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 		 139 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>