22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03051 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03051  hypothetical protein  100 
 
 		 689 aa  1401    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00894237  normal  0.803051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0257  hypothetical protein  39.1 
 
 		 755 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3923  hypothetical protein  36.35 
 
 		 726 aa  294  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1641  hypothetical protein  32.52 
 
 		 651 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.996629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3277  hypothetical protein  27.97 
 
 		 730 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2818  hypothetical protein  26.92 
 
 		 717 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01918  hypothetical protein  32.35 
 
 		 698 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.343555  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3096  hypothetical protein  25.41 
 
 		 729 aa  151  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4010  hypothetical protein  26.69 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328091  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2302  hypothetical protein  29.03 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000035123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5558  hypothetical protein  27.72 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.651155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1424  hypothetical protein  27 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.375453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3121  hypothetical protein  30.82 
 
 		 459 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2095  hypothetical protein  33.54 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629039  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5099  hypothetical protein  30.32 
 
 		 483 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3251  hypothetical protein  29.48 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2659  hypothetical protein  28.42 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3017  hypothetical protein  28.08 
 
 		 441 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2510  hypothetical protein  28.9 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.973885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3908  hypothetical protein  27.2 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0384197  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0671  hypothetical protein  23.44 
 
 		 492 aa  52.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>