70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02617 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02617  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4229  protein of unknown function DUF82  77.69 
 
 		 258 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4339  protein of unknown function DUF82  77.69 
 
 		 258 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.172322 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  47.18 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  47.18 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  47.18 
 
 		 251 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  45.82 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  46.77 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2800  hypothetical protein  48.44 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0306  hypothetical protein  48.44 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00785467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  47.46 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3405  hypothetical protein  49.79 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000396149  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  47.88 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  46.61 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0233  hypothetical protein  49.79 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0265996  hitchhiker  0.00000000670922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  42.86 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  46.03 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0209  hypothetical protein  48.95 
 
 		 246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121486  unclonable  0.00000000000711775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  45.83 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0225  hypothetical protein  47.56 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  44.35 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1812  protein of unknown function DUF82  48.5 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  40.86 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3352  protein of unknown function DUF82  40.65 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.729294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3276  protein of unknown function DUF82  40.42 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.31629  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0859  hypothetical protein  36.05 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.015676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  37.24 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3080  protein of unknown function DUF82  29.32 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.367373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3040  protein of unknown function DUF82  29.5 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10590  hypothetical protein  36.17 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18585e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1519  hypothetical protein  34.07 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00627759  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0327  hypothetical protein  35.96 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359144  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1548  hypothetical protein  34.3 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2002  protein of unknown function DUF82  40 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1285  hypothetical protein  34.15 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2400  protein of unknown function DUF82  37.91 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0147  hypothetical protein  33.49 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0149  hypothetical protein  33.49 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3958  protein of unknown function DUF82  34.31 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  31.39 
 
 		 267 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7452  protein of unknown function DUF82  35.59 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0100  protein of unknown function DUF82  39.7 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.566034  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0341  protein of unknown function DUF82  34.9 
 
 		 158 aa  102  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00210637  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0403  hypothetical protein  35.95 
 
 		 167 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.393997  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_368  hypothetical protein  34 
 
 		 167 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0577491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  38.06 
 
 		 152 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0758  hypothetical protein  37.32 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0072  hypothetical protein  30.52 
 
 		 158 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0153972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1033  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3160  hypothetical protein  44.16 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0872  protein of unknown function DUF82  34 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1175  protein of unknown function DUF82  30.28 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0155  hypothetical protein  30.2 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.292503  normal  0.0192044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1962  protein of unknown function DUF82  32.21 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000351454  decreased coverage  0.00501017 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0441  protein of unknown function DUF82  31.79 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.297493 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1020  hypothetical protein  30.15 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.134843 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0747  hypothetical protein  28.38 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  29.25 
 
 		 145 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2987  protein of unknown function DUF82  29.22 
 
 		 153 aa  53.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1471  hypothetical protein  24.7 
 
 		 164 aa  52  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.863306  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1691  hypothetical protein  33.81 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0219  protein of unknown function DUF82  38.54 
 
 		 167 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1425  hypothetical protein  25.77 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2635  protein of unknown function DUF82  27.61 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1135  protein of unknown function DUF82  28.31 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132995  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0508  hypothetical protein  29.6 
 
 		 136 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0988512 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1167  hypothetical protein  29.46 
 
 		 126 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000347212 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1591  hypothetical protein  29.52 
 
 		 162 aa  42.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>