261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02384 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  71.67 
 
 
553 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  100 
 
 
549 aa  1095    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  71.38 
 
 
545 aa  693    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  71.98 
 
 
553 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  73.26 
 
 
553 aa  772    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  69.35 
 
 
566 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  66.85 
 
 
549 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  67.53 
 
 
552 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  72.96 
 
 
554 aa  752    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  72.78 
 
 
552 aa  726    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  67.41 
 
 
548 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  65.37 
 
 
537 aa  658    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  72.04 
 
 
545 aa  706    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  65.25 
 
 
549 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  67.53 
 
 
552 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  91.29 
 
 
575 aa  967    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  68.01 
 
 
558 aa  713    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  68.45 
 
 
550 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  67.22 
 
 
547 aa  698    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  66.3 
 
 
556 aa  697    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  71.38 
 
 
545 aa  692    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  67.34 
 
 
545 aa  696    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  72.04 
 
 
553 aa  709    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  91.29 
 
 
575 aa  967    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  65 
 
 
551 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  71.48 
 
 
553 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  66.97 
 
 
552 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  63.82 
 
 
556 aa  632  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  63.77 
 
 
546 aa  626  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  62.32 
 
 
553 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  58.96 
 
 
538 aa  610  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  59.92 
 
 
467 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  59.92 
 
 
467 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  59.59 
 
 
467 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  59.96 
 
 
475 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  58.76 
 
 
467 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  40.65 
 
 
570 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  46.48 
 
 
463 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  47.45 
 
 
471 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 
456 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  43.53 
 
 
507 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  46.87 
 
 
464 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  47.15 
 
 
464 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 
455 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 
518 aa  360  4e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  44.35 
 
 
448 aa  333  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
433 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  37.1 
 
 
412 aa  286  8e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  36.85 
 
 
418 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  37 
 
 
413 aa  261  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  35.57 
 
 
411 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  36.33 
 
 
424 aa  256  7e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 
424 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  34.47 
 
 
406 aa  236  9e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  33.97 
 
 
424 aa  233  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  35.41 
 
 
397 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  34.2 
 
 
401 aa  213  9e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  32.29 
 
 
428 aa  190  7e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  32.13 
 
 
442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
453 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  30.72 
 
 
938 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
425 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 
416 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  26 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
407 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  28.64 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  27.62 
 
 
418 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
421 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  26.61 
 
 
421 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  35.79 
 
 
679 aa  120  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
421 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
421 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  25.55 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
415 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  29.55 
 
 
438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  27.08 
 
 
442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.74 
 
 
412 aa  109  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 
414 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  26.21 
 
 
410 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.42 
 
 
412 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.89 
 
 
410 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.97 
 
 
436 aa  106  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  27.25 
 
 
412 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  25.6 
 
 
404 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 
434 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  23.79 
 
 
402 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  23.79 
 
 
402 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  23.63 
 
 
398 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  28.57 
 
 
404 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  23.63 
 
 
398 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  23.63 
 
 
398 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  23.63 
 
 
398 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  23.63 
 
 
398 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
430 aa  101  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  29.74 
 
 
430 aa  101  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 
411 aa  99.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  22.45 
 
 
400 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>