132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02211 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  68.79 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  68.79 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  67.43 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  68.79 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  68.79 
 
 		 299 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  68.79 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  68.79 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  68.79 
 
 		 299 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  71.01 
 
 		 296 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  64.53 
 
 		 295 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  65.58 
 
 		 229 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  44.72 
 
 		 313 aa  195  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  39.78 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  39.42 
 
 		 314 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  39.15 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4689  metallophosphoesterase  37.98 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596745  normal  0.125787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  43.72 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  41.64 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  42.74 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  40.27 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  38.43 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  40 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  40.08 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  38.43 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  38.43 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  38.43 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  37.94 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  36.82 
 
 		 314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5326  metallophosphoesterase  36.82 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  31.19 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  34.24 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0908  hypothetical protein  56.57 
 
 		 117 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79622  normal  0.0768341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  28.14 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  30.13 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  30.74 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  29.95 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  33.13 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  32.2 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  29.29 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  28.37 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  26.94 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  31.66 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  30.58 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  36.59 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  23.11 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  36.59 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.74 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.69 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.69 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3342  hypothetical protein  28.18 
 
 		 574 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.69 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  30.73 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4273  metallophosphoesterase  28.12 
 
 		 680 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117744  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  27.94 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  31.4 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  31.4 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  30.59 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  31.07 
 
 		 1421 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  26.32 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.69 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  33.69 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.69 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.69 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1764  metallophosphoesterase  27.61 
 
 		 529 aa  55.8  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305861  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  30.05 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  24.34 
 
 		 470 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  30.54 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  29.61 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4466  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  28 
 
 		 820 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.07 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4314  hypothetical protein  29.36 
 
 		 571 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  30.43 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0906  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  26.86 
 
 		 819 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  26.7 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.07 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.12 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.38 
 
 		 616 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0436  putative calcineurin phosphoesterase  27.74 
 
 		 519 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  25.98 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0869  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  27.43 
 
 		 819 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  25.31 
 
 		 496 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  23.75 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0726  metallophosphoesterase  26.86 
 
 		 820 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.972215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  29.9 
 
 		 1174 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0980  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  26.29 
 
 		 819 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0264  metallophosphoesterase  26.21 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.019445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1452  metallophosphoesterase  26.34 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  28.22 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  27.17 
 
 		 265 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1080  metallophosphoesterase  26.95 
 
 		 659 aa  49.3  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1563  metallophosphoesterase  29.55 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  31.52 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  28.66 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  30.36 
 
 		 1138 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2363  metallophosphoesterase  35.29 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361854 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  27.32 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5374  hypothetical protein  27.43 
 
 		 551 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332513  normal  0.110357 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>