More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02171 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  100 
 
 		 448 aa  895    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  62.92 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 436 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 428 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 		 425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  37.96 
 
 		 446 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  38.88 
 
 		 449 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  35.48 
 
 		 454 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 419 aa  272  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  34.73 
 
 		 454 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  34.73 
 
 		 454 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.11 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  35.4 
 
 		 463 aa  266  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  36.66 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  36.66 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  35.01 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 447 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 447 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  37.03 
 
 		 436 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  37.9 
 
 		 451 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  34.99 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  35.99 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  34.77 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 447 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 467 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  36.41 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  35.29 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  35.29 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  37.18 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  34.67 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  34.62 
 
 		 444 aa  256  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 458 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  34.62 
 
 		 444 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  34.62 
 
 		 444 aa  256  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  34.62 
 
 		 444 aa  256  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  34.62 
 
 		 444 aa  256  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  34.62 
 
 		 444 aa  256  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  34.62 
 
 		 444 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  34.62 
 
 		 444 aa  256  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  34.98 
 
 		 432 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  34.98 
 
 		 432 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  35.25 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  34.98 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  35.1 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  34.99 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  33.94 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  35.1 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0277  d-galactonate transporter  35.71 
 
 		 446 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370556 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  37.65 
 
 		 478 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 466 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  33.64 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  37.1 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2810  D-galactonate transporter  35.71 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0296  d-galactonate transporter  35.71 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  35.24 
 
 		 450 aa  250  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  35.01 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  36.64 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  36.3 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  35.02 
 
 		 446 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  36.64 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  33.26 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  33.92 
 
 		 485 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  33.26 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  33.26 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  33.26 
 
 		 445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  33.26 
 
 		 445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  35.55 
 
 		 434 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  34.52 
 
 		 457 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  36.99 
 
 		 448 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  36.99 
 
 		 448 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  36.99 
 
 		 448 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  36.99 
 
 		 448 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  36.99 
 
 		 448 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  36.99 
 
 		 448 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  36.99 
 
 		 448 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  33.03 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  33.03 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>