More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02109 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  100 
 
 		 438 aa  855    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  88.76 
 
 		 438 aa  689    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  88.76 
 
 		 438 aa  689    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  64.11 
 
 		 444 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  60.99 
 
 		 443 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.91 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.91 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 		 445 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  50.23 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  50.23 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  50.23 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  50.23 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  50.23 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  50.23 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  50.23 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  50.23 
 
 		 438 aa  362  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.45 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.37 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  50.91 
 
 		 448 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.91 
 
 		 448 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.91 
 
 		 448 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.43 
 
 		 433 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  44.55 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  49.66 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 444 aa  298  9e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0275  histidine kinase  49.39 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 454 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  43.88 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.74 
 
 		 466 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  41.23 
 
 		 459 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.07 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  41 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  41 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  41 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  41 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  41 
 
 		 1093 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  40.27 
 
 		 449 aa  250  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  43.7 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  38.42 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  38.42 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  39.35 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  41.19 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  37.59 
 
 		 499 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  44.08 
 
 		 513 aa  223  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  34.16 
 
 		 471 aa  222  9e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  34.16 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  43.96 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 524 aa  216  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  41.05 
 
 		 517 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  34.42 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  42.81 
 
 		 501 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.48 
 
 		 515 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  33.33 
 
 		 455 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 519 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 517 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.43 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 515 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 517 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  40.23 
 
 		 518 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 517 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  42.11 
 
 		 517 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  34.91 
 
 		 446 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 		 515 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4099  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 431 aa  203  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 494 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  41.57 
 
 		 494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 494 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  37.58 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 		 494 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.217081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  42.18 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  38.68 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  40.52 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 481 aa  196  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 443 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 462 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  39.8 
 
 		 505 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  36.32 
 
 		 471 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>