160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02013 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  100 
 
 		 136 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  91.6 
 
 		 143 aa  258  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  91.6 
 
 		 143 aa  258  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  53.68 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  52.27 
 
 		 152 aa  151  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  54.96 
 
 		 144 aa  146  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 		 140 aa  139  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  52.27 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.53 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  29.45 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.47 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.24 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  31.58 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  29.6 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  25.78 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.09 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.61 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 292 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.47 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  29.77 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.53 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  23.44 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.02 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.39 
 
 		 289 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  32.47 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.81 
 
 		 285 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  23.88 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  22.66 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.63 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  24.44 
 
 		 314 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.39 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 		 289 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 287 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  24.22 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  24.22 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  24.22 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  24.22 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  24.22 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  24.22 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  24.22 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  24.22 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.34 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.88 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  24.44 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  24.22 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  22.92 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  24.49 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.38 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.38 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>