84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01962 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  320  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  71.34 
 
 		 160 aa  244  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  71.34 
 
 		 160 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  71.34 
 
 		 160 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  71.34 
 
 		 160 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  71.34 
 
 		 160 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  71.34 
 
 		 160 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  71.34 
 
 		 160 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  71.34 
 
 		 159 aa  239  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  70.06 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  70.06 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  70.06 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  70.06 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  69.87 
 
 		 161 aa  234  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  68.79 
 
 		 161 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  68.79 
 
 		 161 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  57.05 
 
 		 159 aa  177  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  57.32 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  36.88 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  37.84 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  34.84 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2624  GPW/gp25 family protein  36.64 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3098  hypothetical protein  36.64 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2766  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.64 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0113374  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2508  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.11 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  32.48 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  34.38 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4955  hypothetical protein  33.09 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  33.55 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  38.52 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  37.78 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  31.41 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  36.62 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.76 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  32.21 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  32.89 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.63 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.59 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6047  hypothetical protein  27.45 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183356  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  30 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  35.64 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.35 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.83 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  32.21 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  32.21 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  32.21 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.92 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  32.21 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  32.21 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.47 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.2 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  32.21 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  32.21 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  30.82 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  31.85 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  27.27 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.85 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  27.27 
 
 		 235 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.86 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.88 
 
 		 183 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  30.92 
 
 		 185 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.67 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  29.94 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.06 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.48 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.04 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.88 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  28.66 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  28.66 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  28.66 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  28.66 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  28.29 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  28.66 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.75 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  28.66 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  28.66 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.56 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  34.06 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1730  hypothetical protein  34.82 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0454443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.7 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  34.67 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>