22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01955 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01955  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  761    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.409206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  31.88 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  26.17 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  25.19 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  25.99 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  24.77 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  26.45 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  24.43 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  22.52 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  26.01 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  26.01 
 
 		 259 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  24.44 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2611  hypothetical protein  25.44 
 
 		 319 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0183477  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3114  hypothetical protein  22.91 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  24.09 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2114  hypothetical protein  24.05 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3619  hypothetical protein  25.98 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00105207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3618  hypothetical protein  24.05 
 
 		 297 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00152122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3617  hypothetical protein  24.43 
 
 		 298 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00595661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  26.43 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  27.43 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>