118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01923 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  100 
 
 		 325 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  25.49 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  28.95 
 
 		 330 aa  92.4  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  27.6 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  25.96 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  23.99 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  26.88 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  26.18 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  28.33 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  29.41 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  29.41 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  24.7 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  30.65 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  29.41 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  30.35 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  30.35 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  30.35 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  26.16 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  26.54 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  23.58 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  26.15 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  24.33 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  23.4 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  26.54 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  24.81 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  26.15 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  26.15 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  26.15 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  26.15 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  25 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  25.48 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  22.71 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  23.55 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  26.04 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  27.37 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  26.72 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  25 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  25.63 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  25 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  24 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  25.1 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  23.57 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  25.36 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  25.08 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  26.71 
 
 		 349 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  25.95 
 
 		 363 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  22.48 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2063  Fatty acid desaturase  26.82 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  22.55 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  23.5 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  24.84 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  26.42 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  22.39 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  23.81 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  24.64 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  24.64 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.65 
 
 		 765 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  23.46 
 
 		 685 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  35.38 
 
 		 362 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  24 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  24.18 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  25.4 
 
 		 352 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5636  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 344 aa  52.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.2 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  36.99 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  24.42 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  25 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  28 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.44 
 
 		 357 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  27.05 
 
 		 341 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  25 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  24.79 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  21.29 
 
 		 361 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  21.29 
 
 		 361 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  21.29 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  21.29 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  21.29 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  21.29 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  20.91 
 
 		 361 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6001  fatty acid desaturase  24.74 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6492  fatty acid desaturase  24.74 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  20.91 
 
 		 361 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02366  putative transmembrane acyl-COA desaturase (fatty acid desaturase) oxidoreductase protein  21.7 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0749638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  24.39 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  25.75 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  25.75 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  20.91 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  23.27 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  23.36 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  21.2 
 
 		 372 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  45.65 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  23.21 
 
 		 486 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  24.57 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  24.9 
 
 		 364 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  22.98 
 
 		 357 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  24.72 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  22.68 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>