More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01766 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  61.43 
 
 		 227 aa  254  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  58.69 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  57.28 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  56.81 
 
 		 247 aa  241  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  58.45 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  56.81 
 
 		 219 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  57.01 
 
 		 244 aa  238  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  57.82 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  57.34 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  54.59 
 
 		 219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  55.66 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  54.59 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  55.76 
 
 		 219 aa  231  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  53.02 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  54.42 
 
 		 226 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  54.59 
 
 		 219 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  53.52 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  58.55 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  52.56 
 
 		 224 aa  224  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  53.49 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  52.97 
 
 		 250 aa  222  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  55.35 
 
 		 230 aa  221  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  53.47 
 
 		 217 aa  221  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  51.63 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  53.33 
 
 		 228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  53.61 
 
 		 230 aa  218  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  59.79 
 
 		 214 aa  215  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  52.58 
 
 		 218 aa  215  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  48.57 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  51.17 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  50.7 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  51.61 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  52.43 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  51.46 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  52.85 
 
 		 221 aa  201  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  52.85 
 
 		 221 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  55.15 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  45.45 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  52.58 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  54.72 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  51.04 
 
 		 191 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  49.52 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  42.04 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  42.78 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  45.58 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.81 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  42.98 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.98 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  42.29 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  42 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  39.56 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.34 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  41.51 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  41.78 
 
 		 229 aa  141  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 		 237 aa  141  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  37.61 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  35.37 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.13 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  40.09 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  40.18 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  42.78 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  42.79 
 
 		 223 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  40.18 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.96 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  41.63 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 222 aa  135  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  41.89 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  38.6 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  38.1 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  37.95 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  36.68 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  37.39 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  37.72 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  38.39 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  35.81 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  37.28 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  39.47 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  38.86 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  38.72 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  41.78 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  41.67 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  37.99 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  38.53 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.53 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  37.18 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  34.27 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  38.53 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  39.27 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  38.1 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.53 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  38.53 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  37.44 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  38.12 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  40.53 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  38.43 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  39.38 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>