16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00816 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  954    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1521  mannosyltransferase OCH1 related enzyme  28.33 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000001768  normal  0.448905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2550  glycosyl transferase  32.09 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  32 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1208  hypothetical protein  29.82 
 
 		 236 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403711 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  29.52 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 		 711 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2375  hypothetical protein  26.67 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3246  hypothetical protein  30.36 
 
 		 234 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2599  hypothetical protein  30.95 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2137  hypothetical protein  23.7 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0601271  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2395  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  24.62 
 
 		 243 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1167  polysaccharide biosynthesis protein CpsM(V)  32.65 
 
 		 241 aa  53.9  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.10639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0322  mannosyltransferase OCH1-related enzyme  31.52 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3144  hypothetical protein  24.88 
 
 		 252 aa  46.6  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0778094  normal  0.041607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1961  hypothetical protein  25.89 
 
 		 631 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>