218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00792 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  100 
 
 
81 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  90.12 
 
 
83 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  90.12 
 
 
83 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  90.12 
 
 
85 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  86.25 
 
 
82 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  86.25 
 
 
82 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  85.19 
 
 
81 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  85.19 
 
 
81 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  61.33 
 
 
80 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  58.67 
 
 
82 aa  97.1  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  58.67 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  57.33 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  60 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  57.33 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  57.33 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  57.33 
 
 
82 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  56 
 
 
82 aa  94.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  57.33 
 
 
82 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  57.33 
 
 
82 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  56 
 
 
82 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  53.16 
 
 
85 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  56 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  59.46 
 
 
82 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  53.25 
 
 
82 aa  89.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  56 
 
 
83 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  49.37 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  49.37 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  51.25 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  48.68 
 
 
82 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  50.62 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  52.5 
 
 
93 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  49.37 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  48.72 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  48.75 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  50 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  43.59 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  39.51 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  44.3 
 
 
88 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  38.67 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  36.36 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  36.36 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  36.36 
 
 
97 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  36.36 
 
 
97 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  36.36 
 
 
97 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  39.51 
 
 
87 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  32.91 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  34.21 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  36.25 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  31.58 
 
 
81 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  31.58 
 
 
81 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  37.66 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  31.58 
 
 
82 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  36.11 
 
 
77 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  32.47 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  37.5 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  36.67 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  36 
 
 
79 aa  52  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  34.21 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  34.21 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  51.25 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  34.57 
 
 
84 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  34.18 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  35.62 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  32.89 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  37.33 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  32.47 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  32 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  31.94 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  34.67 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  32.88 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  31.51 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  34.25 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  30.86 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  36.23 
 
 
74 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  31.58 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  32.93 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  31.58 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  32.89 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  33.33 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  30.86 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  32.84 
 
 
79 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  30.86 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  31.17 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  31.94 
 
 
79 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  33.33 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  31.88 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  31.94 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  29.63 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  30.14 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  31.43 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  29.73 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  31.94 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  27.27 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  34.29 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  30.86 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  33.33 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  30.56 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  34.78 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  28.21 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>