217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00778 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  298  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  81.69 
 
 		 144 aa  244  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  82.61 
 
 		 143 aa  244  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  82.61 
 
 		 143 aa  244  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  81.69 
 
 		 144 aa  244  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  80.15 
 
 		 143 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  71.22 
 
 		 142 aa  216  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  71.22 
 
 		 142 aa  215  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  55.38 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.13 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  54.89 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  51.13 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  49.62 
 
 		 144 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.88 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  55.38 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 		 140 aa  157  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 		 144 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 		 143 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 		 144 aa  156  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 		 143 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 		 143 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 		 144 aa  156  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  49.62 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  54.62 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  50 
 
 		 135 aa  150  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  57.5 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  49.62 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 		 149 aa  146  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.86 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  49.14 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  42.11 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  42.65 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  35.71 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  31.65 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  30.23 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  36.45 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  34.21 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.51 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  27.61 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  27.87 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.31 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  29.57 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  29.2 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  27.4 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  31.87 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.87 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  27.87 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.87 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  28.43 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.87 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.87 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.87 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.87 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.08 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  36.47 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  34 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  27.43 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  27.43 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>