More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00761 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  80.33 
 
 		 242 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  80.33 
 
 		 242 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  77.14 
 
 		 244 aa  387  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  76.33 
 
 		 242 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  72.51 
 
 		 250 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  72.81 
 
 		 239 aa  348  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  72.81 
 
 		 239 aa  347  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  65.94 
 
 		 241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  65.67 
 
 		 239 aa  315  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  64.19 
 
 		 244 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  42.57 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  30.3 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33.01 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3264  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  37.9 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  37.98 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 188 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.18 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  30.69 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.11 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  35.92 
 
 		 341 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  42.71 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.05 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 363 aa  65.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  34.26 
 
 		 351 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.29 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.91 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.59 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  26.19 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  34.26 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.37 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  27.15 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  33.33 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.22 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  37 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  31.17 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 1106 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  38.38 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  37.25 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  36 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 273 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.31 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 271 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.52 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 348 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.52 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.57 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.76 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.25 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  35.04 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  32.48 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  36.89 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.96 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.69 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>