More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00759 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  100 
 
 		 419 aa  855    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  84.48 
 
 		 419 aa  723    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  80.1 
 
 		 414 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  80.3 
 
 		 416 aa  685    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  84.48 
 
 		 419 aa  723    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  79.85 
 
 		 414 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  72.95 
 
 		 415 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  73.2 
 
 		 415 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  62.13 
 
 		 409 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  61.1 
 
 		 409 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  59.11 
 
 		 416 aa  491  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  54.35 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  53.66 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  53.66 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  56.34 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  53.73 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  53.73 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  53.73 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  53.17 
 
 		 435 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  54.77 
 
 		 415 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  53.35 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  53.23 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  53.9 
 
 		 409 aa  461  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  52.84 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  54.34 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  52.06 
 
 		 429 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  52.09 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  56.97 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  52.68 
 
 		 424 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  55.69 
 
 		 410 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  51.35 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  51.86 
 
 		 414 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  51.09 
 
 		 413 aa  428  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  55.73 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  51.87 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  43.87 
 
 		 413 aa  347  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  41.32 
 
 		 415 aa  341  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  38.73 
 
 		 415 aa  315  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  38.82 
 
 		 415 aa  313  4.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  40.15 
 
 		 417 aa  309  6.999999999999999e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  37.4 
 
 		 416 aa  282  7.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  34.62 
 
 		 461 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  33.17 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  30.68 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  33.42 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  33.42 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  29.92 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.91 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  30.59 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.96 
 
 		 449 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  30.71 
 
 		 455 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  31.22 
 
 		 441 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  32.42 
 
 		 495 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  31.62 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  32.73 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  34.15 
 
 		 507 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  30.58 
 
 		 413 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  31.32 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  29.85 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  29.36 
 
 		 506 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  29.68 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  29.85 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  29.85 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  30.08 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  32.07 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 		 647 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  29.19 
 
 		 584 aa  96.3  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  30.49 
 
 		 618 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  28.18 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  29.31 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 606 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  29.23 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  26.33 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  27.81 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  25.15 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  27.16 
 
 		 568 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.99 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.09 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.91 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.61 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  26.03 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  24.79 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  24.05 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  24.24 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  33.61 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  23.17 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  23.46 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.58 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>