More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00411 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00411  putative aminopeptidase transmembrane protein  100 
 
 		 748 aa  1550    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  71.64 
 
 		 738 aa  1096    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.604033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3156  Membrane alanyl aminopeptidase  51.92 
 
 		 743 aa  685    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315095  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4680  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  71.64 
 
 		 738 aa  1096    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5329  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  48.08 
 
 		 727 aa  628  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2818  M1 family peptidase  47.67 
 
 		 721 aa  625  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.316749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3622  peptidase  47.67 
 
 		 746 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178496  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3637  M1 family peptidase  47.67 
 
 		 721 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3161  M1 family peptidase  47.67 
 
 		 721 aa  625  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0040  M1 family peptidase  47.67 
 
 		 721 aa  625  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3613  M1 family peptidase  47.67 
 
 		 721 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1727  M1 family peptidase  47.67 
 
 		 721 aa  625  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2945  M1 family peptidase  47.03 
 
 		 740 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2903  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  45.15 
 
 		 723 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0397  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  46.36 
 
 		 722 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244204  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  45.93 
 
 		 722 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.476849  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0424  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  46.21 
 
 		 722 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2613  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  45.79 
 
 		 722 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0466  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  45.93 
 
 		 722 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3582  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  45.48 
 
 		 722 aa  595  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.564307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02632  aminopeptidase N  33.68 
 
 		 890 aa  298  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.88 
 
 		 886 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.92 
 
 		 882 aa  265  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0443  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.11 
 
 		 888 aa  251  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.089278  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.67 
 
 		 830 aa  230  7e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.31 
 
 		 877 aa  230  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  29.62 
 
 		 890 aa  227  8e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204376 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  29.93 
 
 		 895 aa  222  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  28.29 
 
 		 870 aa  216  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.88 
 
 		 863 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  28.85 
 
 		 881 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.45 
 
 		 859 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  27.04 
 
 		 883 aa  214  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.27 
 
 		 857 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.76 
 
 		 913 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0620443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  30.33 
 
 		 905 aa  209  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.04 
 
 		 853 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.99 
 
 		 859 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.54 
 
 		 859 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.92 
 
 		 852 aa  204  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.83 
 
 		 932 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.51 
 
 		 785 aa  200  9e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.48 
 
 		 784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.25 
 
 		 933 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.1 
 
 		 932 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.62 
 
 		 778 aa  191  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31787  alanine/arginine aminopeptidase  26.5 
 
 		 870 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  28.06 
 
 		 875 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04910  leucyl aminopeptidase, putative  25.48 
 
 		 1018 aa  177  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  29.84 
 
 		 844 aa  176  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0341  lysyl aminopeptidase  28.63 
 
 		 846 aa  175  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0324  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.47 
 
 		 874 aa  174  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161681  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  30.32 
 
 		 877 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  31.86 
 
 		 856 aa  166  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  29.48 
 
 		 844 aa  166  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  31.32 
 
 		 877 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  31.32 
 
 		 877 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  31.32 
 
 		 918 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  31.32 
 
 		 877 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  25.9 
 
 		 846 aa  164  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  29.82 
 
 		 877 aa  163  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0335  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.41 
 
 		 878 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  27.43 
 
 		 853 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1883  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  31.44 
 
 		 843 aa  159  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  28.42 
 
 		 862 aa  159  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0347  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.28 
 
 		 878 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.707127  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  29.41 
 
 		 877 aa  158  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  24.95 
 
 		 906 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  28.88 
 
 		 877 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  28.88 
 
 		 877 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6491  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.28 
 
 		 929 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  30 
 
 		 875 aa  156  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  31.36 
 
 		 889 aa  155  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  30.47 
 
 		 869 aa  154  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.1 
 
 		 854 aa  153  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  30.47 
 
 		 861 aa  153  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  26.42 
 
 		 861 aa  152  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  29.8 
 
 		 867 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  29.8 
 
 		 867 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  29.28 
 
 		 851 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  29.51 
 
 		 867 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0504  lysyl aminopeptidase  28.82 
 
 		 844 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.777579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  27.88 
 
 		 879 aa  148  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  24.84 
 
 		 848 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  27.01 
 
 		 858 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  26.42 
 
 		 848 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  30.26 
 
 		 854 aa  145  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  24.6 
 
 		 850 aa  145  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  29.02 
 
 		 887 aa  145  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  29.66 
 
 		 882 aa  144  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.51 
 
 		 878 aa  144  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  26.56 
 
 		 852 aa  144  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43257  predicted protein  24.55 
 
 		 948 aa  144  7e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.393184  normal  0.929698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  28.78 
 
 		 862 aa  142  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  26.01 
 
 		 849 aa  140  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  27.51 
 
 		 853 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  26.09 
 
 		 855 aa  140  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  26.84 
 
 		 849 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  26.93 
 
 		 889 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  28.94 
 
 		 887 aa  138  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>