More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00409 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  46.33 
 
 		 1034 aa  944    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  36.92 
 
 		 1045 aa  679    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  46.93 
 
 		 1034 aa  931    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  42.59 
 
 		 1053 aa  803    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  41.93 
 
 		 1048 aa  764    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  36.93 
 
 		 1052 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  42.93 
 
 		 1021 aa  765    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  68.64 
 
 		 1032 aa  1404    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  66.16 
 
 		 1033 aa  1404    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  38.93 
 
 		 1033 aa  674    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  42.72 
 
 		 1070 aa  798    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  36.57 
 
 		 1032 aa  643    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  44.58 
 
 		 1016 aa  789    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  100 
 
 		 1049 aa  2087    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  37.13 
 
 		 1038 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.26 
 
 		 1481 aa  653    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  41.13 
 
 		 1064 aa  770    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1943  cation efflux system protein CzcA  37.36 
 
 		 1024 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  40.38 
 
 		 1038 aa  728    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  38.48 
 
 		 1066 aa  730    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  39.43 
 
 		 1075 aa  733    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  41.53 
 
 		 1053 aa  782    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  42.42 
 
 		 1077 aa  783    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  42.18 
 
 		 1049 aa  816    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  42.36 
 
 		 1052 aa  810    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  41.21 
 
 		 1054 aa  777    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  76.31 
 
 		 1036 aa  1508    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  40.2 
 
 		 1033 aa  690    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  39.96 
 
 		 1029 aa  729    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  43.48 
 
 		 1032 aa  809    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  36.39 
 
 		 1051 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  43.67 
 
 		 1032 aa  810    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  45.43 
 
 		 1028 aa  752    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  39.6 
 
 		 1039 aa  723    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  75.6 
 
 		 1038 aa  1492    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  41.82 
 
 		 1075 aa  788    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  43.2 
 
 		 1037 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0143  heavy metal efflux pump CzcA  43.89 
 
 		 1023 aa  693    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.609125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  42.88 
 
 		 1059 aa  795    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  36.66 
 
 		 1060 aa  642    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  42.79 
 
 		 1066 aa  773    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  42.7 
 
 		 1077 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  65.65 
 
 		 1045 aa  1323    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  39.71 
 
 		 1047 aa  760    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  40.85 
 
 		 1062 aa  756    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  37.05 
 
 		 1056 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  41.43 
 
 		 1050 aa  797    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  42.44 
 
 		 1070 aa  799    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  37.01 
 
 		 1045 aa  692    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  45.76 
 
 		 1034 aa  898    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  42.93 
 
 		 1028 aa  759    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  38.91 
 
 		 1065 aa  750    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  38.65 
 
 		 1064 aa  728    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  37.59 
 
 		 1037 aa  689    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  39.73 
 
 		 1021 aa  741    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  64.71 
 
 		 1040 aa  1338    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  38.88 
 
 		 1070 aa  722    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  40.99 
 
 		 1019 aa  776    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  41.09 
 
 		 1058 aa  714    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  42.98 
 
 		 1077 aa  797    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  46.26 
 
 		 1022 aa  807    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  37.57 
 
 		 1051 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  44.41 
 
 		 1026 aa  749    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  38.83 
 
 		 1083 aa  727    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  37.79 
 
 		 1456 aa  708    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  41.09 
 
 		 1043 aa  780    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  40.23 
 
 		 1038 aa  738    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  36.99 
 
 		 1052 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  71 
 
 		 1031 aa  1465    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  39.73 
 
 		 1029 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  41.55 
 
 		 1040 aa  788    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  42.84 
 
 		 1046 aa  772    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  42.45 
 
 		 1083 aa  797    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  38.08 
 
 		 1077 aa  707    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  41.86 
 
 		 1070 aa  773    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  37.27 
 
 		 1043 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  41.12 
 
 		 1070 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  41.43 
 
 		 1056 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  43.46 
 
 		 1026 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  37.82 
 
 		 1060 aa  664    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  36.86 
 
 		 1065 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  41.66 
 
 		 1069 aa  785    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  42.23 
 
 		 1072 aa  785    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  37.1 
 
 		 1060 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  41.11 
 
 		 1079 aa  762    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  36.74 
 
 		 1058 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  43.37 
 
 		 1063 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  39.3 
 
 		 1037 aa  718    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6145  proton antiporter cation efflux protein NccA  37.05 
 
 		 1076 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  37.55 
 
 		 1076 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  75.15 
 
 		 1023 aa  1521    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  42.52 
 
 		 1043 aa  806    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  36.61 
 
 		 1055 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  37.45 
 
 		 1045 aa  690    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  37.62 
 
 		 1039 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  37.73 
 
 		 1027 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2579  heavy metal efflux pump CzcA  38.74 
 
 		 1081 aa  707    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.820402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  39.15 
 
 		 1455 aa  759    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  40.26 
 
 		 1075 aa  722    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  35.33 
 
 		 1032 aa  661    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>