22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00378 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4985  major facilitator transporter  87.19 
 
 		 399 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00378  putative transport transmembrane protein  100 
 
 		 399 aa  790    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4463  major facilitator transporter  85.93 
 
 		 399 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0895  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.519067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.37 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2624  macrolide efflux protein  22.59 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2897  putative transporter  22.59 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000603201 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2935  transporter, putative  22.07 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00291638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2945  putative transporter  22.07 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000764756  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2896  transporter  22.59 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2698  transporter  22.59 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2912  putative transporter  21.74 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2647  macrolide efflux protein  22.26 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2334  putative transporter  21.74 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.609115  hitchhiker  0.000374493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 422 aa  43.1  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>