23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00362 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00362  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  643    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3576  amidinotransferase  73.62 
 
 		 354 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0346338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3944  amidinotransferase  72.96 
 
 		 336 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2543  amidinotransferase  72.96 
 
 		 333 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5310  amidinotransferase  72.64 
 
 		 346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3491  amidinotransferase  72.64 
 
 		 333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.736651  normal  0.0264598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2391  hypothetical protein  73.31 
 
 		 305 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482221  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1164  amidinotransferase family protein  63.16 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0253709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02830  uncharacterized conserved protein with pentein-type domain  59.62 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2023  amidinotransferase family protein  56.59 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0193  hypothetical protein  41.18 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1270  hypothetical protein  42.24 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5776  hypothetical protein  40.85 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0365  pentein-type domain-containing protein  39.87 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.529714  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05890  hypothetical protein  39.47 
 
 		 309 aa  229  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1720  pentein-type domain-containing protein  39.67 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0873915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4680  hypothetical protein  36.48 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2742  hypothetical protein  33.11 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2881  hypothetical protein  33.11 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001028  hypothetical protein  33.77 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0243  hypothetical protein  35.08 
 
 		 326 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07112  hypothetical protein  33.55 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31738  predicted protein  39.33 
 
 		 302 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.193058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>