273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00361 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
349 aa  720    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  74.29 
 
 
350 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  74.29 
 
 
350 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  74 
 
 
350 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  69.32 
 
 
349 aa  464  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  69.16 
 
 
359 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  65.27 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  69.16 
 
 
359 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  65.47 
 
 
358 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  64.37 
 
 
354 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  68.86 
 
 
359 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  68.56 
 
 
359 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  68.86 
 
 
359 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  66.07 
 
 
369 aa  448  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  63.72 
 
 
365 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  67.52 
 
 
350 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  62.91 
 
 
349 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  63.99 
 
 
362 aa  424  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  69.72 
 
 
328 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  59.94 
 
 
365 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  61.29 
 
 
382 aa  408  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  60.66 
 
 
359 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  58.48 
 
 
358 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  60.96 
 
 
366 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  57.58 
 
 
358 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  57.88 
 
 
358 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  59.21 
 
 
346 aa  391  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  56.29 
 
 
348 aa  388  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  58.91 
 
 
350 aa  384  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  59.39 
 
 
348 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  54.46 
 
 
339 aa  381  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  61.37 
 
 
352 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  58.98 
 
 
343 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  56.36 
 
 
351 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  56.8 
 
 
357 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  53.78 
 
 
357 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  53.94 
 
 
348 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  55.13 
 
 
350 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  56.21 
 
 
343 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  56.53 
 
 
334 aa  362  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  50.3 
 
 
366 aa  352  4e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  50.3 
 
 
340 aa  333  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  50 
 
 
353 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  42.94 
 
 
336 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  42.94 
 
 
336 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  43.47 
 
 
345 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  33.7 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  31.63 
 
 
329 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.21 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  32.18 
 
 
326 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.89 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  32.84 
 
 
324 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  32.18 
 
 
326 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  34.26 
 
 
313 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 
311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  29.72 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 
323 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.6 
 
 
325 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  30.88 
 
 
323 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  31.06 
 
 
331 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.05 
 
 
351 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 
338 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.45 
 
 
313 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 
329 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  31.02 
 
 
359 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  28.78 
 
 
338 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  30.63 
 
 
323 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 
329 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.6 
 
 
325 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 
325 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 
345 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  29.85 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 
330 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 
325 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  30.26 
 
 
323 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 
325 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 
325 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 
325 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  29.89 
 
 
326 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  27.99 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.36 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.6 
 
 
323 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  27.84 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  30.31 
 
 
321 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  30.86 
 
 
325 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  30 
 
 
330 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  29.6 
 
 
323 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 
313 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  26.83 
 
 
325 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 
328 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.14 
 
 
321 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.51 
 
 
303 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  32.05 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>